170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3714 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 226 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  97.35 
 
 		 226 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  87.61 
 
 		 223 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  91.78 
 
 		 229 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  91.46 
 
 		 170 aa  271  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  45 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  42.31 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  41.48 
 
 		 197 aa  85.1  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 		 206 aa  85.1  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  38.33 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  40.34 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  40.5 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  46 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  41.18 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  36.91 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  40.49 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  43 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  38.6 
 
 		 119 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 		 174 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 		 174 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  37.9 
 
 		 178 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  43.14 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  37.19 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.44 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  38.56 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  37.17 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.71 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  35.26 
 
 		 613 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  38.39 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  38.39 
 
 		 121 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  37.96 
 
 		 121 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  39.33 
 
 		 121 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  32.21 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  43.36 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  39.33 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  34.76 
 
 		 605 aa  65.5  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  37.04 
 
 		 869 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  38.89 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  35.82 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.35 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  37 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  34.85 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  34.31 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.14 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  34.31 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  34.31 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  34.25 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  39.1 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  40.4 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  42.42 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 		 590 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  31.38 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  30.23 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  32.92 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  38.41 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  33.05 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  31.36 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.54 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  31.01 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  31.01 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  31.01 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  31.01 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  37.76 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  35.85 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  39.83 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  31.01 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  31.01 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  37 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  34.69 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  37 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  38.78 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  37 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  37 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  38.98 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  37.76 
 
 		 519 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  36.51 
 
 		 576 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  30.23 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  31.82 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  32.67 
 
 		 544 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  32.67 
 
 		 544 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  31.4 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  31.72 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  31.68 
 
 		 547 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 131 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  35.11 
 
 		 128 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  35.11 
 
 		 128 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  32.32 
 
 		 139 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>