186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1943 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  100 
 
 
127 aa  260  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  73.81 
 
 
128 aa  190  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  73.81 
 
 
128 aa  190  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  73.81 
 
 
128 aa  190  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  52.83 
 
 
124 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  55.45 
 
 
124 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  52.83 
 
 
124 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  46.83 
 
 
124 aa  117  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  46.83 
 
 
124 aa  117  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  54.46 
 
 
124 aa  117  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  48.28 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  48.28 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  48.28 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  48.28 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  47.41 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  48.28 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  47.41 
 
 
124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  50 
 
 
124 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  46.09 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  46.61 
 
 
126 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  47.37 
 
 
126 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  59.74 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  41.27 
 
 
120 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  43.69 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  41.9 
 
 
121 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  35.9 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  42.55 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  41.49 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  39.81 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  39.81 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  39.81 
 
 
121 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  40.74 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  41.12 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  38.24 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  41.58 
 
 
143 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  41.58 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  37.74 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  39.6 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  39.34 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  36.79 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  34.13 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  34.13 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  40.78 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  41 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  39.8 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  39.8 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  39.8 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  40.78 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  29.37 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  42.98 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  33.67 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  36.08 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  33.67 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 
564 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  38.94 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 
565 aa  64.7  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  30 
 
 
560 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  34 
 
 
265 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  34.15 
 
 
869 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  35.16 
 
 
539 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  35.9 
 
 
226 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  35.9 
 
 
223 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  38 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  30.25 
 
 
172 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  35.9 
 
 
226 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  31 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  31.73 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 
284 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  25.66 
 
 
210 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  37.76 
 
 
193 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  28.09 
 
 
578 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 
244 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  32.99 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  29.17 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1963  copper resistance protein, putative  34.21 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  26.27 
 
 
116 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  34.69 
 
 
225 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  36 
 
 
229 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  34.69 
 
 
241 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1154  copper resistance protein, putative  34.21 
 
 
180 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.972359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0951  putative copper resistance protein  34.21 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1001  putative copper resistance protein CopC  34.21 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  26.67 
 
 
173 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>