154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1275 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 605 aa  1128    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  37.31 
 
 		 559 aa  259  7e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.56 
 
 		 564 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  35.44 
 
 		 565 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  34.71 
 
 		 560 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 		 551 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  33.74 
 
 		 649 aa  213  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  34.76 
 
 		 578 aa  207  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  37.61 
 
 		 607 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  31.74 
 
 		 593 aa  127  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  23.81 
 
 		 544 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  23.81 
 
 		 544 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  27.98 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  25.65 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  27.86 
 
 		 590 aa  114  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  25.54 
 
 		 549 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  36.14 
 
 		 577 aa  113  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  30.41 
 
 		 869 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  25.07 
 
 		 544 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  24.52 
 
 		 547 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  25.54 
 
 		 544 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  25.58 
 
 		 547 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  24.67 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  31.22 
 
 		 546 aa  98.2  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  29.06 
 
 		 528 aa  97.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  28.67 
 
 		 576 aa  92.8  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  23.82 
 
 		 663 aa  90.9  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  20.6 
 
 		 927 aa  89  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  27.09 
 
 		 519 aa  87  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  22.9 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  39.39 
 
 		 208 aa  82.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  43.33 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  39.19 
 
 		 588 aa  80.5  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  40.83 
 
 		 184 aa  80.1  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  36.51 
 
 		 223 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  42.15 
 
 		 229 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  42.15 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  41.32 
 
 		 226 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  43.69 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  28.37 
 
 		 539 aa  74.7  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  39.22 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  35.65 
 
 		 188 aa  72.8  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  29.82 
 
 		 697 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  40.4 
 
 		 197 aa  69.3  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  38.84 
 
 		 119 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  36.46 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  43.43 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  42.03 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  39.45 
 
 		 126 aa  67.4  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  44.9 
 
 		 265 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  41.22 
 
 		 241 aa  66.6  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  40 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  38.98 
 
 		 199 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  40.82 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  29.06 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 124 aa  64.7  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  41.05 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  35.11 
 
 		 210 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 118 aa  63.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  37.1 
 
 		 174 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  36.15 
 
 		 173 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  42.42 
 
 		 244 aa  62  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  43.88 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  38.17 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  34.96 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  35.38 
 
 		 141 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  35.38 
 
 		 141 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.69 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  29.92 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  35.82 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  34.06 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  34.31 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  27.2 
 
 		 513 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5680  copper resistance D domain-containing protein  39.68 
 
 		 307 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027818 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  31.02 
 
 		 309 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  30.53 
 
 		 172 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.37 
 
 		 124 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  38.6 
 
 		 144 aa  55.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  37.93 
 
 		 184 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  30.39 
 
 		 124 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.79 
 
 		 227 aa  55.1  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  31 
 
 		 121 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  33.88 
 
 		 122 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  24.35 
 
 		 571 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  30.39 
 
 		 124 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  30.39 
 
 		 124 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  28.35 
 
 		 128 aa  54.3  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  28.35 
 
 		 128 aa  54.3  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  28.35 
 
 		 128 aa  54.3  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  30.39 
 
 		 124 aa  54.3  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  30.39 
 
 		 124 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  30.39 
 
 		 124 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  36.88 
 
 		 316 aa  53.9  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>