148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  100 
 
 		 233 aa  443  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  44.96 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  40.67 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.99 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  45.22 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  38.04 
 
 		 199 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  46.36 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  38.33 
 
 		 126 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 869 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  35.1 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.3 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  38.76 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  37.69 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  39.68 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  31.76 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  38.89 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  41.12 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  44 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  31.88 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 607 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  38.61 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  36.63 
 
 		 141 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  36.63 
 
 		 141 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  35.71 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  36.23 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  37.88 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  39.25 
 
 		 559 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  34.17 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 551 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  39.72 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  36.15 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 124 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  37 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  35.35 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  36.03 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.33 
 
 		 565 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  35.35 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  36.45 
 
 		 577 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  30.67 
 
 		 564 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  35.11 
 
 		 172 aa  62  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  37.25 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 605 aa  61.6  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  34.75 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  32.54 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  34.55 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  35.35 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  32.69 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.32 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.32 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 		 513 aa  60.1  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  35.35 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  35.92 
 
 		 593 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  28.69 
 
 		 547 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  35.05 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  35.05 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  35.05 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  35.05 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  34.45 
 
 		 118 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  31.68 
 
 		 121 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  33.62 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  27.21 
 
 		 549 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  35.65 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  37.08 
 
 		 121 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  28 
 
 		 547 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  33.33 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  34.85 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  36.28 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  27.64 
 
 		 549 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  33.94 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  30.69 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  37.23 
 
 		 649 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  27.64 
 
 		 544 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  29.46 
 
 		 544 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  26.24 
 
 		 547 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  28.48 
 
 		 613 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  35.96 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  27.8 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  33.85 
 
 		 131 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 		 172 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  32.23 
 
 		 124 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 546 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  35 
 
 		 128 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  35 
 
 		 128 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  35 
 
 		 128 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  35.05 
 
 		 139 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 124 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  28.47 
 
 		 590 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  31.73 
 
 		 560 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>