96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2571 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  100 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  47.09 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  45.14 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  43.18 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.96 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  40.98 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  39.39 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  36.32 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  40.44 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  40.74 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  40.65 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  45.54 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  37.61 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  40.49 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  38.1 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  33.16 
 
 		 182 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  36.72 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  43.88 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  39.84 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  33.17 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  41.88 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  39.84 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  39.66 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  32.7 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  35.97 
 
 		 869 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  34.4 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  35.45 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  36.43 
 
 		 576 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  36.97 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  32.94 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  37.36 
 
 		 605 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  36.45 
 
 		 424 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  36.21 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.95 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  29.77 
 
 		 434 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  38.32 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  35 
 
 		 173 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  30.91 
 
 		 122 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 551 aa  51.2  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  34.86 
 
 		 539 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 127 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.89 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  30.27 
 
 		 590 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  31.4 
 
 		 547 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  34.69 
 
 		 607 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.82 
 
 		 565 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  32.14 
 
 		 121 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  31.06 
 
 		 564 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 513 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  31.4 
 
 		 544 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  32.41 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 119 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  30.65 
 
 		 544 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  31.4 
 
 		 549 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 125 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  30.65 
 
 		 544 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  34.74 
 
 		 649 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  30.58 
 
 		 547 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  31.82 
 
 		 578 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 		 141 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  30.43 
 
 		 128 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 		 124 aa  45.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  30.43 
 
 		 128 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 		 141 aa  46.2  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  30.58 
 
 		 547 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.75 
 
 		 549 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 		 528 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 593 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.41 
 
 		 613 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  28.93 
 
 		 544 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  26.28 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  26.38 
 
 		 272 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  36.14 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  31.97 
 
 		 125 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  32.63 
 
 		 519 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 121 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 121 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 121 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  34.26 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  34.26 
 
 		 121 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  28.89 
 
 		 172 aa  41.2  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>