182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3277 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 528 aa  984    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  66.15 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  50.38 
 
 		 519 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  50.1 
 
 		 539 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  45.29 
 
 		 576 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  27.59 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  28.01 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.06 
 
 		 613 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  29.6 
 
 		 559 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  38.53 
 
 		 513 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  27.11 
 
 		 564 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  27.6 
 
 		 565 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  27.07 
 
 		 590 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  29.5 
 
 		 551 aa  90.1  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  22.16 
 
 		 547 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  21.82 
 
 		 544 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  21.9 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  20.86 
 
 		 544 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  20.86 
 
 		 544 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  21.19 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  21.54 
 
 		 544 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  20.49 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  20.49 
 
 		 549 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  38.78 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  22.67 
 
 		 663 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  30.99 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  21.16 
 
 		 927 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  29.74 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  39.18 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  27.11 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 208 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.8 
 
 		 197 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  36.54 
 
 		 664 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  36.08 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  38.89 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  40.4 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  34.75 
 
 		 869 aa  63.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36.61 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  28.33 
 
 		 173 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  38.19 
 
 		 302 aa  63.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  31.2 
 
 		 364 aa  63.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  36.28 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  38.89 
 
 		 229 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  34.69 
 
 		 319 aa  62  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  38.84 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.12 
 
 		 731 aa  60.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  35.19 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  38.33 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  34.01 
 
 		 288 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  28.3 
 
 		 632 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 678 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  34.68 
 
 		 226 aa  60.1  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  33.04 
 
 		 692 aa  58.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  33.8 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  38.38 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  22.86 
 
 		 649 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  36.73 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  33.07 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  30.97 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  37.4 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.33 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  34.58 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 130 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  37.37 
 
 		 291 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  34.34 
 
 		 265 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  31.19 
 
 		 184 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  35.43 
 
 		 722 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  37.37 
 
 		 291 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 546 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  37.37 
 
 		 291 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  37.37 
 
 		 291 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 178 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  31.71 
 
 		 210 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  38.83 
 
 		 284 aa  55.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 126 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  33.1 
 
 		 294 aa  54.7  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  33.1 
 
 		 294 aa  54.7  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  30.89 
 
 		 140 aa  54.3  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  33.33 
 
 		 144 aa  54.3  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  28.69 
 
 		 140 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  28.69 
 
 		 140 aa  53.9  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  35.53 
 
 		 290 aa  53.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  35.44 
 
 		 697 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1389  copper resistance D domain-containing protein  24.59 
 
 		 296 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  35.92 
 
 		 125 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  30.43 
 
 		 137 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  37.58 
 
 		 310 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  29.95 
 
 		 651 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 128 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.81 
 
 		 233 aa  52.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  34.69 
 
 		 203 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 128 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  26.78 
 
 		 718 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  29.17 
 
 		 132 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  29.41 
 
 		 686 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 197 aa  52.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 210 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>