128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1742 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 137 aa  283  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0808  hypothetical protein  35.04 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  30.83 
 
 		 590 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4019  copper resistance protein CopC  37.04 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 613 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  32.69 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  34.31 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  34.31 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  34.31 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  34.31 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  33.33 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  28.85 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  28.85 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  32.81 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  28.85 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  30.1 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  30.17 
 
 		 519 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  29.7 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  29.7 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  30.1 
 
 		 544 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  30.1 
 
 		 544 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  28.7 
 
 		 173 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  27.2 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  29.82 
 
 		 184 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  29.13 
 
 		 547 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  31.5 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  31.5 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  29.29 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  30.48 
 
 		 174 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  30.48 
 
 		 174 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  31.5 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  31.5 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  31.03 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  31.68 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  31.68 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  29.36 
 
 		 197 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  30.48 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  31.68 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  29.63 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  28.85 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  30.43 
 
 		 528 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.5 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.13 
 
 		 549 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  29.13 
 
 		 544 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  31.5 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  33.01 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  30.1 
 
 		 547 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  30.77 
 
 		 549 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  29.13 
 
 		 547 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  29.66 
 
 		 539 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  30.56 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  24.37 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 111 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  30.7 
 
 		 210 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  28.46 
 
 		 226 aa  50.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 		 173 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  28.16 
 
 		 544 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5431  copper resistance protein CopC  31.68 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  28.33 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  28.07 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  29.25 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  26.92 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  26.05 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  29.57 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  29.57 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 593 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  27.83 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 170 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  21.43 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  27.88 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  27.88 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  31.73 
 
 		 576 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  26.85 
 
 		 513 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  27.03 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  28.44 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  29.17 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  26.47 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  27.55 
 
 		 578 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  24.16 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  25.21 
 
 		 244 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  28.85 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.52 
 
 		 197 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  27.83 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  26.92 
 
 		 265 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  29.35 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>