145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2238 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 126 aa  256  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  54.78 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  46.85 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  47.37 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  45.61 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  49.07 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  49.07 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  49.07 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  47.12 
 
 		 124 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  45.79 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  47.12 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  47.12 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  40.16 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  45.1 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  42.5 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  41.67 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  51.95 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  36.22 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  46.67 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  42.31 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  43.69 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  43.69 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  41.35 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  41.35 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  35.09 
 
 		 111 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  41.35 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  33.63 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  35.43 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  37.86 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  41 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  37.74 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  33.01 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  42 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  42 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  42 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  30.08 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  39 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  35.45 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  37.86 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  39.83 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  37.96 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  37.96 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  39.83 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  34.91 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  33.94 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  28.7 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  28.44 
 
 		 544 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  33.94 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  27.52 
 
 		 544 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  27.52 
 
 		 547 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  27.52 
 
 		 544 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  34.51 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  27.52 
 
 		 549 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  27.27 
 
 		 547 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  27.52 
 
 		 544 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  32.2 
 
 		 539 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  27.27 
 
 		 549 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 210 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  31.5 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  31.5 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  31.15 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.1 
 
 		 547 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  30.84 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  33.06 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  33.06 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  29.84 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  30.84 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  30.84 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  31.13 
 
 		 125 aa  52  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  33.94 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  32.95 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  35.53 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  29.77 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>