146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2173 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 130 aa  264  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  80.15 
 
 		 133 aa  193  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  51.4 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  46.43 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  46.46 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  50.45 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  55 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  49.55 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  49.55 
 
 		 121 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  50.5 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  42.75 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  48.51 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  48.51 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  48.51 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  51.06 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  51.46 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  51.46 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  51.06 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  50.89 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  46.49 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  46.49 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  49.44 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  41.38 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  44.55 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  39.66 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  52.7 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  42.2 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  39.09 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  47.19 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  46.07 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0796  copper resistance protein, putative  51.96 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  42.7 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  42.7 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  42.7 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  34.86 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 590 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1154  copper resistance protein, putative  50 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.972359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1963  copper resistance protein, putative  50 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  36.75 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0951  putative copper resistance protein  50 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0994  putative copper resistance protein CopC  50 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00681058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1001  putative copper resistance protein CopC  50 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0874  putative copper resistance protein  50 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0274  putative copper resistance protein  50 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.024138  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  38.26 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  38.39 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  34.55 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  34.55 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  38.24 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  38.24 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  38.24 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  34.45 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  38.24 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  31.62 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  36.79 
 
 		 613 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  30.7 
 
 		 547 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  35.96 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  35.96 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  36.52 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  30.09 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  30.39 
 
 		 544 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  30.39 
 
 		 544 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  29.82 
 
 		 549 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  30.39 
 
 		 549 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  31.25 
 
 		 547 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  30.39 
 
 		 544 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  36.75 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  28.91 
 
 		 547 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  28.07 
 
 		 544 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  36.79 
 
 		 564 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  29.31 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  38.32 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  32.11 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  36.79 
 
 		 565 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  29.29 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  30.77 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  31.71 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 		 226 aa  51.6  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  34.68 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  31.19 
 
 		 128 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  32.54 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  32.63 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>