125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2140 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2425  copper resistance protein CopC  61.26 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  51.92 
 
 		 125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  48.08 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  43.31 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  47.12 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  47.12 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  46.67 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  43.31 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  45.19 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  44.88 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  43.93 
 
 		 129 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5669  copper resistance protein C  41.35 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  44.86 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  43.93 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  42.99 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  41.38 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  40.95 
 
 		 128 aa  88.6  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  41.35 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  41.82 
 
 		 120 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  38.53 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  32.26 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  36.8 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  30.84 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  35.83 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  29.06 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  37.1 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  32.23 
 
 		 160 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  35.43 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  32.52 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  34.15 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  32.56 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  32.56 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  32.81 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  33.61 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  32.5 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  28.91 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  35.94 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  36.51 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  33.08 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  35.94 
 
 		 869 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  36.51 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 		 613 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  36.22 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  28.12 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  32.79 
 
 		 241 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  34.55 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  28.7 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  37.74 
 
 		 225 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  28.7 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  28.7 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  28.7 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  28.7 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  30.63 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  34.29 
 
 		 590 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  32.82 
 
 		 539 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  28.32 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  27.43 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  27.91 
 
 		 549 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4019  copper resistance protein CopC  33.94 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  27.91 
 
 		 549 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  27.91 
 
 		 544 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  27.13 
 
 		 544 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1963  copper resistance protein, putative  46.51 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0796  copper resistance protein, putative  47.62 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1154  copper resistance protein, putative  47.62 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.972359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0951  putative copper resistance protein  46.51 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0874  putative copper resistance protein  47.62 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0994  putative copper resistance protein CopC  46.51 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00681058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1001  putative copper resistance protein CopC  46.51 
 
 		 123 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0274  putative copper resistance protein  47.62 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.024138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  27.13 
 
 		 547 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  29.52 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 223 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  34.26 
 
 		 226 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  37.04 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>