87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4019 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4019  copper resistance protein CopC  100 
 
 
122 aa  249  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659263  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5431  copper resistance protein CopC  44.34 
 
 
106 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  35.9 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  33.87 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  34.45 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  33.87 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  34.45 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  33.87 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  33.87 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  35.64 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  33.06 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  33.87 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  33.87 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  35.64 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  35.64 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  35.64 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  30.36 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  30.36 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  30.36 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  33.88 
 
 
125 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  29.6 
 
 
565 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  30 
 
 
564 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  29.82 
 
 
544 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0808  hypothetical protein  30.09 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  29.31 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  28.33 
 
 
544 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  29.82 
 
 
549 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  28.33 
 
 
549 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  29.82 
 
 
547 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  31.9 
 
 
571 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  32.35 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  28.57 
 
 
208 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 
869 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.07 
 
 
544 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.07 
 
 
544 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  26.85 
 
 
210 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  28 
 
 
547 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  33.94 
 
 
127 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  30.28 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  31.07 
 
 
160 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  28.07 
 
 
547 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  30.69 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  31.73 
 
 
560 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  30.69 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  27.19 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  27.73 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  30.88 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  30.88 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  30.83 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  28.95 
 
 
126 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 
226 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  34.86 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  29.41 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  33.96 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2425  copper resistance protein CopC  32.73 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  30.69 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 
593 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 
124 aa  43.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  27.64 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  34.95 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  26.61 
 
 
590 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  28.04 
 
 
184 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  26.47 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  28.21 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  30.36 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  28.3 
 
 
539 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  27.91 
 
 
223 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  27.91 
 
 
170 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.36 
 
 
613 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.09 
 
 
197 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  30.51 
 
 
141 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 
588 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  30.51 
 
 
141 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  26.98 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  26.92 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  26.79 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  30.56 
 
 
197 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  29.46 
 
 
528 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  31 
 
 
244 aa  40  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  28.33 
 
 
226 aa  40  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.73 
 
 
214 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  23.53 
 
 
122 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>