116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5005 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 197 aa  377  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  45.71 
 
 		 272 aa  94.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  41.44 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  38.52 
 
 		 869 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  45 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  43.48 
 
 		 172 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  42.06 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  40.19 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  34.18 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  37.23 
 
 		 173 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  33.08 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  40.83 
 
 		 519 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.03 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  39.67 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  38.66 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  38.26 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  34.11 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  34.11 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.63 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  34.17 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  38.36 
 
 		 576 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  36.77 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  31.22 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  37.14 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  33.7 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  34.68 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  31.29 
 
 		 528 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  37.14 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  33.12 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  27.16 
 
 		 544 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  27.16 
 
 		 544 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  36.94 
 
 		 593 aa  54.7  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  36.09 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  35.33 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  35.61 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 590 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  28.33 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  33.94 
 
 		 284 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  26.49 
 
 		 544 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  30.28 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  26.67 
 
 		 547 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  34.91 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  34.45 
 
 		 539 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  37.3 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  27.46 
 
 		 549 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 560 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32.06 
 
 		 564 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.54 
 
 		 565 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  27.46 
 
 		 544 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  34.88 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  32.03 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  32.03 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  29.1 
 
 		 547 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  32.03 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  27.35 
 
 		 547 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  27.64 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  27.91 
 
 		 549 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  33.58 
 
 		 578 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  36.51 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  36.51 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  32.52 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  34.86 
 
 		 424 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 122 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  33.96 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  30.37 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  28.74 
 
 		 546 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  34.38 
 
 		 126 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  32.03 
 
 		 126 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 434 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  27.7 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  38.98 
 
 		 607 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  33.87 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  29.6 
 
 		 124 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  31.9 
 
 		 124 aa  45.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 128 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5669  copper resistance protein C  34.29 
 
 		 128 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 513 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  31.13 
 
 		 125 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 124 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  35.53 
 
 		 512 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 130 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  32.41 
 
 		 132 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  28.8 
 
 		 126 aa  44.7  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  28.8 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  28.8 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 120 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 559 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  28.8 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  30.95 
 
 		 605 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  28.8 
 
 		 124 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 		 125 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  28.8 
 
 		 124 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  42.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>