103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0497 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 120 aa  243  6.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2223  copper resistance protein CopC  72.63 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.213465 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1207  copper resistance protein CopC  47.17 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  30.28 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  27.88 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  32.46 
 
 		 869 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.96 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  33 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  27.73 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  28.23 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  28.23 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  28.23 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  30.33 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.2 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.52 
 
 		 565 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32.52 
 
 		 564 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  27.36 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  31.63 
 
 		 560 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  26.79 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  26.72 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  26.67 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  32.73 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  32.08 
 
 		 244 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  24.14 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  25 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  24.14 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  24.14 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  26.61 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  30 
 
 		 144 aa  46.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  27.87 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  29 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  29.52 
 
 		 593 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  29.75 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  30.09 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  30.09 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  31.36 
 
 		 590 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  30.09 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  28.35 
 
 		 547 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  27.87 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.29 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 		 284 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  51.43 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  32.28 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  40.91 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  31.87 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  25.51 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  25.51 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  38.78 
 
 		 632 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  25.51 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  30.58 
 
 		 208 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  29.17 
 
 		 277 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  27.05 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  45.71 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  48.57 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  45.71 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  25 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  45.71 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  25.64 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  24.82 
 
 		 173 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  32.69 
 
 		 588 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  31.94 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  22.69 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  22.69 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  24.11 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  28.04 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  48.57 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  28.12 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  26.74 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  28.3 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.61 
 
 		 613 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  26.77 
 
 		 547 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  31.87 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  28.3 
 
 		 125 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  28.93 
 
 		 189 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  38.33 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  26.92 
 
 		 546 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  55.17 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 697 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  25.41 
 
 		 544 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  25.41 
 
 		 544 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 513 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00388  putative copper resistance (CopC-like) protein  28.85 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  25.98 
 
 		 549 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4019  copper resistance protein CopC  28.16 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  27.35 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  29.57 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  25.98 
 
 		 547 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  21.74 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>