230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3973 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  97.17 
 
 		 564 aa  991    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 565 aa  1095    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  57.83 
 
 		 560 aa  548  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  47.27 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  36.9 
 
 		 559 aa  269  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 649 aa  252  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  35.13 
 
 		 605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  35.82 
 
 		 577 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  35.08 
 
 		 551 aa  190  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  35.07 
 
 		 607 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  27.22 
 
 		 544 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.79 
 
 		 613 aa  153  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  26.41 
 
 		 547 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  25.44 
 
 		 549 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  25.87 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  26.21 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  26.25 
 
 		 549 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  25.87 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  25.69 
 
 		 547 aa  145  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  26.41 
 
 		 547 aa  143  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  30.66 
 
 		 546 aa  133  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  32.18 
 
 		 869 aa  123  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  26.07 
 
 		 590 aa  123  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  27.34 
 
 		 663 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  23.29 
 
 		 927 aa  107  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  27.6 
 
 		 528 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  26.53 
 
 		 519 aa  90.5  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  38.53 
 
 		 588 aa  88.2  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  28.49 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  24.57 
 
 		 439 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  43.52 
 
 		 593 aa  84  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  28.98 
 
 		 632 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  35.26 
 
 		 576 aa  76.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  73.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  35.56 
 
 		 173 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  28.3 
 
 		 697 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  38.1 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  30.53 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  30.33 
 
 		 364 aa  70.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  39.52 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  38.66 
 
 		 118 aa  70.5  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  35.61 
 
 		 208 aa  70.1  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 174 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 174 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  31.53 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  30.67 
 
 		 173 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  33.33 
 
 		 319 aa  67  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  30.25 
 
 		 128 aa  67  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  34.07 
 
 		 309 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 244 aa  66.6  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  34.55 
 
 		 124 aa  67  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  30.25 
 
 		 128 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  30.25 
 
 		 128 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  40.59 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  29.04 
 
 		 512 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  40.59 
 
 		 314 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  30.53 
 
 		 172 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 127 aa  64.7  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  29.07 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.17 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  35.57 
 
 		 687 aa  63.9  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  33.94 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1130  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 132 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0394457  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  28.95 
 
 		 571 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  30.14 
 
 		 182 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  30.97 
 
 		 121 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  31.86 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  31.86 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  34.51 
 
 		 210 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  30.91 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  31.86 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  31.86 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  30.97 
 
 		 124 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  31.86 
 
 		 124 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  32.97 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  32.97 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.86 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 		 124 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  35.85 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 119 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  30.71 
 
 		 116 aa  60.1  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  35.2 
 
 		 178 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  30.97 
 
 		 124 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  32.41 
 
 		 189 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  38.38 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  32.54 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.92 
 
 		 731 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  33.61 
 
 		 125 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  38.38 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  41.58 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  31.1 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.78 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  31.2 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  38.02 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  31.67 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  34.78 
 
 		 692 aa  56.6  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  30.49 
 
 		 305 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  29.63 
 
 		 124 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5430  copper resistance protein CopC  28.36 
 
 		 552 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.283558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>