120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1716 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 128 aa  256  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 128 aa  256  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  53.12 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  52.34 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  52.34 
 
 		 128 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  52.34 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  54.05 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  52.85 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5669  copper resistance protein C  60.19 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  59.05 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  54.37 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  52.25 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  55.05 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  53.4 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  54.13 
 
 		 128 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  49.11 
 
 		 130 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  50 
 
 		 126 aa  110  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  46.6 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2425  copper resistance protein CopC  38.68 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  37.74 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  34.58 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  35.14 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  35.43 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  33.85 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  35.51 
 
 		 539 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  36.28 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  29.23 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  37.39 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  35.4 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  30.66 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  31.5 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  35.4 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  35.4 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  35.4 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  30.84 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  28.24 
 
 		 206 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  31.34 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  31.34 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  31.34 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  33.94 
 
 		 241 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  32.74 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  31.15 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  37.14 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  33.64 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.92 
 
 		 613 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 272 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  29.37 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  33.07 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  32.71 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  28.8 
 
 		 565 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 225 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  32.71 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  34.59 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  33.01 
 
 		 284 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  28.8 
 
 		 564 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  30.88 
 
 		 208 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  31.9 
 
 		 590 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 		 210 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  29.23 
 
 		 122 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  25.78 
 
 		 528 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 		 197 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  29.23 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  30.3 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  33.03 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 		 560 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  30.43 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  29.81 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 		 229 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  31.85 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  34.91 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 226 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  32.71 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  32.81 
 
 		 576 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  30.56 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.83 
 
 		 547 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  27.35 
 
 		 549 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  31.15 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  27.35 
 
 		 544 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  28.69 
 
 		 519 aa  42  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  30.56 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  24.43 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  30.56 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  44.68 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  32.08 
 
 		 593 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  30.56 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>