165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2807 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 229 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  91.51 
 
 		 226 aa  349  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  85.05 
 
 		 223 aa  343  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  92.45 
 
 		 226 aa  330  9e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  88.82 
 
 		 170 aa  262  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  45 
 
 		 265 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  42.02 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  41.48 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  41.54 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  41.61 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  36.36 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  38.84 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  37.82 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  45 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  40.91 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  38.6 
 
 		 119 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  39.67 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  40.25 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  32.21 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  38.74 
 
 		 539 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.44 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  35.96 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  35.96 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  38.1 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  42.16 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  37.1 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  38.38 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  39.46 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  40.86 
 
 		 605 aa  65.5  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  35.53 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  33.52 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 121 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 121 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 613 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  36.61 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  37.04 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  38.89 
 
 		 528 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  39.64 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  37.27 
 
 		 869 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 		 118 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  30.39 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  40.62 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  35 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.33 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  38.52 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  32.38 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.04 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  36.72 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  42.42 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  32.03 
 
 		 593 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  35.85 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  34.44 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  35.65 
 
 		 590 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 551 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  33.93 
 
 		 663 aa  55.1  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  29.23 
 
 		 124 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  29.23 
 
 		 124 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  29.23 
 
 		 124 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.3 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 607 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  29.23 
 
 		 124 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  39.34 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  35.35 
 
 		 120 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  36.75 
 
 		 576 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  33 
 
 		 126 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  32.32 
 
 		 131 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  33 
 
 		 126 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 122 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  33 
 
 		 126 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  33.93 
 
 		 519 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  29.37 
 
 		 124 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  29.37 
 
 		 124 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  31.31 
 
 		 139 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  28.8 
 
 		 547 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  29.23 
 
 		 547 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  31.9 
 
 		 124 aa  52  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  37.8 
 
 		 121 aa  52  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 128 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 128 aa  52  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 128 aa  52  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  29.52 
 
 		 125 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  34 
 
 		 124 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>