166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0115 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  100 
 
 		 121 aa  244  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  62.18 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  50 
 
 		 126 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  48.33 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  45.45 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  41.9 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  37.39 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  39.18 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  41 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  38.05 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  38.05 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  38.05 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  37.61 
 
 		 143 aa  83.6  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  37.61 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  39.18 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  40.21 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  39.82 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  40.21 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  40.21 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  35.85 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  37.72 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  39.22 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  37.82 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  41 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  41 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  41 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  36.11 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  42 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  42 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  42 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  44.25 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  41 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  39.13 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  39.13 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  37.72 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  37.72 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  39.13 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  39.13 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  39.13 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  41 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  38.83 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  38.26 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  37.63 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  37.29 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 		 590 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  34.65 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  38.94 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  34.78 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  34.78 
 
 		 613 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  40.79 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  37.14 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  39.22 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  33.87 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  39.22 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  32.48 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  32.48 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  32.41 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  34.23 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  40.54 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  32.73 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  31.73 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 		 564 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 		 565 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5669  copper resistance protein C  36.54 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  28.35 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  30.84 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  33.98 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  34.95 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  34.95 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  34.95 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  31 
 
 		 560 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  30.43 
 
 		 578 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  30.39 
 
 		 547 aa  57.8  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.7 
 
 		 544 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.68 
 
 		 233 aa  57  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.7 
 
 		 544 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  33.98 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  28.7 
 
 		 549 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>