154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5140 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 174 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 174 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  98.85 
 
 		 174 aa  331  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  53.94 
 
 		 178 aa  140  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  54.86 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  55.14 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  40.5 
 
 		 188 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  39.46 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.71 
 
 		 197 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  38.82 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  34.88 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  45 
 
 		 244 aa  77.8  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  37.84 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  37.69 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  36.43 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  37.14 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  41.46 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  32.77 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  36.8 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  36.11 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 564 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 565 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  39.62 
 
 		 590 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  37.04 
 
 		 241 aa  68.2  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  42.11 
 
 		 284 aa  67.8  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  38.89 
 
 		 210 aa  67.8  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  35.51 
 
 		 869 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  35.4 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  40.74 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  33.88 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.16 
 
 		 613 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 559 aa  64.7  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 513 aa  64.3  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  33.06 
 
 		 226 aa  64.3  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.58 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  33.05 
 
 		 119 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  34.06 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  33.06 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  33.06 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  34.16 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  37.82 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  39.62 
 
 		 560 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  39.22 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  30.08 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  34.75 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  36.5 
 
 		 607 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  32.28 
 
 		 546 aa  58.9  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  31.58 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  31.58 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  31.58 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  33.57 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  37.84 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  32.77 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  37.25 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  33.63 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  41.41 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  30.52 
 
 		 588 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 605 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  33.07 
 
 		 576 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  33.67 
 
 		 434 aa  54.3  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  35 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  35 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  35 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 		 225 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  31.3 
 
 		 539 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.63 
 
 		 233 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  37.96 
 
 		 551 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 121 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  36.14 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.61 
 
 		 547 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  30.61 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  31.25 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  30.61 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  30.48 
 
 		 137 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  30.61 
 
 		 124 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  29.92 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  32.99 
 
 		 126 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  25.21 
 
 		 127 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  29.75 
 
 		 124 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  34.58 
 
 		 424 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  32.39 
 
 		 571 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 122 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  32.79 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  34.38 
 
 		 512 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  29.59 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  34.88 
 
 		 272 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.31 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  28.97 
 
 		 528 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  35.71 
 
 		 519 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  26.83 
 
 		 549 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  30.33 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>