177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5192 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 131 aa  263  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  95.52 
 
 		 139 aa  221  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  78.91 
 
 		 126 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  69.91 
 
 		 124 aa  166  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  76.7 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  76.7 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  76.7 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  74.76 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  73.2 
 
 		 126 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  72.16 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  72.16 
 
 		 129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  60.71 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  52.63 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  52.63 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  37.72 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  42.24 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  42.62 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  41.82 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  42.62 
 
 		 121 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  44 
 
 		 121 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  40.98 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  40.98 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  39.34 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  40.32 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  44 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  41.58 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  40.87 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  46.53 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  46.53 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  45 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  41 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 613 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 		 590 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  43.1 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  45.16 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  36.72 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  36.72 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  36.72 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  47.3 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  36.75 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  32.77 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  41.8 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  38.66 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  32.77 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  32.77 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  32.77 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  36.27 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  32.77 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  32.77 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  32.77 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  32.77 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  36.27 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  36.27 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  36.27 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  31.45 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.81 
 
 		 544 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.81 
 
 		 544 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  40.38 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  32.11 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  28.81 
 
 		 547 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  42.02 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1154  copper resistance protein, putative  50 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.972359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  28.81 
 
 		 549 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0951  putative copper resistance protein  50 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0874  putative copper resistance protein  50 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0994  putative copper resistance protein CopC  50 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00681058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1001  putative copper resistance protein CopC  50 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0274  putative copper resistance protein  50 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.024138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  27.97 
 
 		 547 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1963  copper resistance protein, putative  50 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  40.35 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  27.12 
 
 		 547 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  28.44 
 
 		 544 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  28.44 
 
 		 549 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  27.12 
 
 		 544 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  32 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0796  copper resistance protein, putative  45 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  34.91 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  38.64 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  32.5 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  35.54 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  36.43 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  35.43 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  33.64 
 
 		 519 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  28.71 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  33.62 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  37.61 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  28.79 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>