179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0716 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  100 
 
 
129 aa  254  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  100 
 
 
129 aa  254  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  99.21 
 
 
126 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  80.77 
 
 
146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  70.63 
 
 
124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  69.67 
 
 
126 aa  155  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  70.3 
 
 
126 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  70.3 
 
 
126 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  70.3 
 
 
126 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  59.35 
 
 
124 aa  148  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  72.16 
 
 
131 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  71.13 
 
 
139 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  57.66 
 
 
122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  57.66 
 
 
143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  48.25 
 
 
160 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  40.71 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  46.94 
 
 
126 aa  90.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  46.55 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  41.23 
 
 
125 aa  85.5  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  40.52 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  39.64 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  39.64 
 
 
121 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  40.52 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  38.68 
 
 
590 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  40.52 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  39.64 
 
 
121 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 
141 aa  84.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 
141 aa  84.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  41 
 
 
121 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  38.39 
 
 
111 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  43 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  37.84 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  35.45 
 
 
613 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  40 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  38.79 
 
 
119 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  40.45 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  39.33 
 
 
121 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  39.53 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  41.75 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  41.75 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  33.05 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  42.7 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  34.45 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.331332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  34.45 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  34.45 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  34.45 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  34.45 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  34.45 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  34.45 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  34.45 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  33.61 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  38.14 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  36.84 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  39.19 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  38.68 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  34.34 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  43.48 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  29.77 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  37.74 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  37.74 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  38 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  38.24 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.75 
 
 
544 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.75 
 
 
544 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  28.79 
 
 
547 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  31.15 
 
 
547 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  30.43 
 
 
544 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  30.43 
 
 
547 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  31.48 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  29.75 
 
 
544 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.75 
 
 
549 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  38.78 
 
 
241 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.27 
 
 
233 aa  61.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  30.63 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 
210 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 
140 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  38.17 
 
 
189 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 
140 aa  60.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 
208 aa  60.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  29.57 
 
 
549 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1963  copper resistance protein, putative  44.59 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1154  copper resistance protein, putative  44.59 
 
 
180 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.972359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0951  putative copper resistance protein  44.59 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0874  putative copper resistance protein  44.59 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0994  putative copper resistance protein CopC  44.59 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00681058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1001  putative copper resistance protein CopC  44.59 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0274  putative copper resistance protein  44.59 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.024138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5431  copper resistance protein CopC  33.05 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.36 
 
 
208 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  37.04 
 
 
519 aa  57.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  36.54 
 
 
196 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  32.5 
 
 
571 aa  57.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32.46 
 
 
564 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.46 
 
 
565 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>