168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4407 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 121 aa  244  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  98.35 
 
 		 121 aa  243  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  82.64 
 
 		 121 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  80.99 
 
 		 121 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  80.99 
 
 		 121 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  79.34 
 
 		 121 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  60.78 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  57.89 
 
 		 124 aa  114  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  56.73 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  56.73 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  48.41 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1963  copper resistance protein, putative  65.33 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.558403  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  57.14 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1154  copper resistance protein, putative  65.33 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.972359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0994  putative copper resistance protein CopC  65.33 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00681058  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1001  putative copper resistance protein CopC  65.33 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0951  putative copper resistance protein  65.33 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0874  putative copper resistance protein  65.33 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1488  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0274  putative copper resistance protein  65.33 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.024138  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  48.65 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  47.32 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  48.51 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  48.51 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  48.51 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0796  copper resistance protein, putative  54.39 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  50 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  44.23 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  46.39 
 
 		 126 aa  93.6  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  41.67 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  41.67 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  50.52 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  42.27 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  41.24 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  38.79 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  41.23 
 
 		 173 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  41.58 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  43.48 
 
 		 172 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 613 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  44.86 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  38.05 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  40.45 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  40.45 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  40.45 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 590 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  38.52 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  36.75 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  39.83 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  39.05 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  36.75 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  35.9 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  35.9 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  35.9 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  39.39 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  35.9 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  35.9 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  35.9 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  34.29 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  41.18 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  35.04 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  40.71 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  39.47 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 226 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 223 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  34.31 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  34.21 
 
 		 547 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  32.17 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  33.02 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  33.02 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  31.15 
 
 		 549 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  31.15 
 
 		 544 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  33.02 
 
 		 549 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  32.08 
 
 		 547 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  37.93 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  32.08 
 
 		 544 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 564 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 565 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  31.43 
 
 		 547 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2511  copper resistance protein CopC  52.56 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  30.34 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  40.16 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 189 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  37.61 
 
 		 424 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>