121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4536 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  100 
 
 
189 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  42.01 
 
 
211 aa  110  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  40.49 
 
 
206 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  45.83 
 
 
284 aa  86.3  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  45.16 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.74 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  40.28 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  38.52 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  39.02 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  39.29 
 
 
217 aa  72  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  38.52 
 
 
241 aa  71.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  36.54 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  38.79 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  39.68 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  31.43 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  33.33 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.75 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  40.37 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  29.89 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  37.61 
 
 
424 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  32.14 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  35.2 
 
 
180 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  32.31 
 
 
513 aa  63.2  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  36.54 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  36.94 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 
434 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  38.84 
 
 
528 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  31.85 
 
 
564 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 
565 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  34.51 
 
 
590 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  35.29 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 
193 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  39 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  31.71 
 
 
559 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.06 
 
 
197 aa  58.2  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  30.43 
 
 
178 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  39.32 
 
 
593 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  36.73 
 
 
124 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 
124 aa  56.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  27.19 
 
 
544 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  26.96 
 
 
544 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  26.96 
 
 
544 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 
578 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  33.88 
 
 
206 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  26.32 
 
 
547 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  33.96 
 
 
124 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
605 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  32.24 
 
 
226 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.5 
 
 
547 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 
122 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  34.43 
 
 
122 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  35 
 
 
143 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  28.46 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.5 
 
 
613 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 
197 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  25.22 
 
 
549 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  30.19 
 
 
560 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  39.6 
 
 
632 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 
121 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 
121 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  32.14 
 
 
226 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  31.82 
 
 
121 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 
546 aa  52  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  39.05 
 
 
265 aa  52  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  29.1 
 
 
869 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  32.61 
 
 
121 aa  51.6  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 
121 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  36.36 
 
 
146 aa  51.2  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  35.29 
 
 
519 aa  51.6  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  32.61 
 
 
121 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  31.3 
 
 
133 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  26.67 
 
 
549 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  24.35 
 
 
544 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  38.54 
 
 
126 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  27.64 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  28.8 
 
 
223 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  27.64 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  38.54 
 
 
129 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  38.54 
 
 
129 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  33.6 
 
 
576 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  36.89 
 
 
512 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  32.14 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 
126 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 
119 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  33.59 
 
 
539 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  24.6 
 
 
547 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  37.29 
 
 
126 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  34.34 
 
 
126 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  34.34 
 
 
126 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  34.34 
 
 
126 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  35.79 
 
 
131 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  34.74 
 
 
139 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  31.65 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  31.65 
 
 
141 aa  46.6  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  29.37 
 
 
121 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.42 
 
 
227 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>