177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2591 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 196 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  70.85 
 
 		 197 aa  191  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  41.22 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  44.85 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  41.22 
 
 		 226 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  35.14 
 
 		 198 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  35 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  45 
 
 		 265 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  36.65 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  38.68 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  36.76 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  40.38 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  32.58 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  38.79 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  35 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 869 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  39.32 
 
 		 124 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.37 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  41.3 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  39.02 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.16 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  37.19 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  40.37 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  40.37 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  40.22 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  42.72 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.86 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  37.14 
 
 		 559 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  39.45 
 
 		 121 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  32.68 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  29.41 
 
 		 544 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.41 
 
 		 544 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.41 
 
 		 544 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  37.17 
 
 		 424 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.35 
 
 		 547 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  28.57 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  31.39 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  31.39 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  36.17 
 
 		 605 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  36.63 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  27.83 
 
 		 544 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  39.71 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  29.23 
 
 		 547 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  36.97 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  38.89 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  38.94 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  36.19 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  38.89 
 
 		 284 aa  62  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  26.96 
 
 		 549 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  25.86 
 
 		 547 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  37.11 
 
 		 539 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 120 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.54 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  36.54 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  35.85 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  35.85 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  35.85 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  27.47 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 607 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  34.53 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  35.4 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  28 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32.11 
 
 		 564 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  35.19 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.11 
 
 		 565 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  34.62 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  34.62 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  30.42 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  39.25 
 
 		 551 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  35.64 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  36.13 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  30.71 
 
 		 528 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  36.15 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  31.82 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  29.5 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  31.73 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  31.97 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  35.14 
 
 		 593 aa  54.7  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.15 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>