162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2170 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  100 
 
 		 144 aa  290  6e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  43 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  43 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 		 590 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  39 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  40.82 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  32.32 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  34.02 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  34.02 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  34.02 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  32.32 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  33.33 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  37.37 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 223 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  33.65 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  32.43 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  35.35 
 
 		 547 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  29.73 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  35.35 
 
 		 544 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  35.35 
 
 		 544 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  35.35 
 
 		 544 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  35.35 
 
 		 549 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  30.77 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  34.31 
 
 		 613 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  30.34 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  30.93 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  35.35 
 
 		 547 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  30.34 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  36.89 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  31.96 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  31.96 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  34.34 
 
 		 544 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  34.34 
 
 		 547 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  34.34 
 
 		 549 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  31 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  35 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  35.35 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  35.35 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  29.29 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  33.66 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  36.73 
 
 		 577 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  37.25 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  37.25 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  37.25 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  33.67 
 
 		 869 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  34 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 424 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  32.32 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 528 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  35.24 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  35.64 
 
 		 539 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 546 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  32.32 
 
 		 197 aa  52  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  34.34 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 180 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  28.57 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  35.35 
 
 		 565 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 		 182 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.35 
 
 		 564 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  32.67 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  35.05 
 
 		 632 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  31.96 
 
 		 198 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 193 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>