141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1160 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 180 aa  350  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  50.78 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  50 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  50 
 
 		 174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  44.53 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  49.58 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  45.71 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  52.75 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.56 
 
 		 197 aa  90.9  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  50.52 
 
 		 244 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  36.69 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  36.92 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  49.02 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  35.91 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  40.5 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  46.55 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  37.98 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  37.4 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  39.85 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  40.48 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  39.68 
 
 		 226 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  34.51 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  37.98 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  33.73 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 869 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  37.12 
 
 		 590 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  34.3 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32.35 
 
 		 564 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  46.39 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  39.23 
 
 		 607 aa  64.7  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  32.62 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  39.22 
 
 		 560 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  35.09 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  34.38 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  34.38 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.76 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.76 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  39.84 
 
 		 578 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  36.7 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.33 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  36.49 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 		 559 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.66 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  32.5 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  39.2 
 
 		 551 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  31.9 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  39.22 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  38 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  43.96 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  30.41 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  32.99 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  34.65 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  29.84 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  29.84 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  31.78 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 434 aa  54.3  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  28.48 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  34.06 
 
 		 576 aa  54.3  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  30.51 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  30.51 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  30.51 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  30.51 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  30.51 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  31.78 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  31.78 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  30.51 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 121 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 121 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  31.07 
 
 		 127 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  33 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  32.99 
 
 		 126 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  31.51 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  33.33 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  30.7 
 
 		 143 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 		 613 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  29.66 
 
 		 124 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  30.7 
 
 		 122 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  30.84 
 
 		 124 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 513 aa  51.6  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  32.99 
 
 		 129 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  32.99 
 
 		 129 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35 
 
 		 227 aa  51.6  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  29.66 
 
 		 124 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  32.14 
 
 		 121 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  32.35 
 
 		 272 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 225 aa  51.2  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  31.96 
 
 		 131 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  29.9 
 
 		 539 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 		 588 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>