77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4979 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  46.79 
 
 
199 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 
206 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  44.35 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  35.14 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.48 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  30.19 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  40.44 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  41.67 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  40 
 
 
223 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  32.85 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  28.79 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  40.34 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.5 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.23 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  40 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  34.53 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  35.46 
 
 
184 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  39.18 
 
 
434 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  34.62 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  39.58 
 
 
284 aa  58.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  35.46 
 
 
172 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  34.19 
 
 
605 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  33.68 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  35.92 
 
 
265 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  33.58 
 
 
869 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  31.72 
 
 
173 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  32.59 
 
 
172 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  38 
 
 
126 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  31.96 
 
 
144 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 
272 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
119 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 
124 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  32.99 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  35.64 
 
 
125 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 
559 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  29.37 
 
 
173 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  36.67 
 
 
217 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  31.58 
 
 
241 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  33.58 
 
 
197 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  32.69 
 
 
121 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  31.63 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  30.39 
 
 
125 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  33.05 
 
 
128 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  32.69 
 
 
121 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.72 
 
 
613 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  32.69 
 
 
121 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  33 
 
 
127 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.51 
 
 
544 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.51 
 
 
544 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  39.81 
 
 
607 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  30.33 
 
 
547 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  29.46 
 
 
130 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.99 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  29.29 
 
 
121 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  29.47 
 
 
539 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  31.43 
 
 
424 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  32.06 
 
 
571 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  28.35 
 
 
128 aa  43.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  29.51 
 
 
547 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  28.35 
 
 
128 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  30.89 
 
 
590 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  28.35 
 
 
128 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  28.42 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  30.33 
 
 
544 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  30.58 
 
 
203 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  33.77 
 
 
577 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  29.51 
 
 
576 aa  41.6  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  27.87 
 
 
118 aa  41.6  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  35.8 
 
 
551 aa  41.6  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 
126 aa  41.6  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  29.66 
 
 
124 aa  41.6  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  30.25 
 
 
124 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>