150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1127 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 178 aa  340  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  59.24 
 
 		 184 aa  164  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  59.7 
 
 		 174 aa  134  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  61.86 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  61.86 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  44.8 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  50.4 
 
 		 180 aa  101  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.02 
 
 		 197 aa  98.6  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  37.36 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  41.26 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  38.21 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  40.16 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  44.33 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  40.16 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  40.71 
 
 		 241 aa  74.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  39.1 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  35.33 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  34.1 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  37.01 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 869 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  44.74 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  34.2 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  32.18 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  44.44 
 
 		 206 aa  67.4  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  37.8 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  39.18 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  40.96 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  35.96 
 
 		 590 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  33.13 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.68 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  36.73 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 565 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  33.98 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  33.62 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  33.82 
 
 		 547 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  38.17 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 564 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  29.13 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  31.97 
 
 		 549 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  32.81 
 
 		 560 aa  58.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  38.94 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  32.14 
 
 		 544 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  32.14 
 
 		 544 aa  57.8  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  30.77 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  29.24 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  28.32 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  37.04 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  37.62 
 
 		 551 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  37.78 
 
 		 605 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 		 528 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  33.96 
 
 		 546 aa  55.1  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 424 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.03 
 
 		 613 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  33.61 
 
 		 539 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  38.46 
 
 		 519 aa  55.1  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  35.24 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.25 
 
 		 549 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  35.16 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  37.86 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  32.08 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 607 aa  54.3  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  29.25 
 
 		 544 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 513 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  32.81 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  27.48 
 
 		 127 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 559 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  37.61 
 
 		 125 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  38.6 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  28.49 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.77 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  30.08 
 
 		 120 aa  51.2  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  31.68 
 
 		 125 aa  51.2  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 130 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  34.83 
 
 		 577 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  39.09 
 
 		 512 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  39.78 
 
 		 217 aa  48.5  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 		 576 aa  48.5  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  34.29 
 
 		 124 aa  48.5  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  33.03 
 
 		 120 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  30.63 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 121 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 121 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 126 aa  47.8  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 121 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  29.06 
 
 		 124 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  30.83 
 
 		 122 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>