155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0298 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  100 
 
 		 210 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  46.56 
 
 		 434 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  40.7 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  46.96 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  46.67 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  34.93 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  40.59 
 
 		 184 aa  92  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  53.54 
 
 		 284 aa  91.3  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  39.22 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  39.88 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.83 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  33.84 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  39.57 
 
 		 170 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  40.87 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  31.35 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  44.12 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  40.15 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  38.02 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  40.87 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  38.26 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  37.88 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  38.58 
 
 		 869 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  34.62 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  35.37 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  32.11 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  37.61 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  40.15 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  28.64 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  34.09 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  30.73 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 		 119 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  36.29 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  31.98 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.92 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  44.58 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  32.95 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 564 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  32.58 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  33.6 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  37.21 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 590 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  33.66 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  38.83 
 
 		 607 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  31.15 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  31.15 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  31.15 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  34.43 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  39.81 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  32.28 
 
 		 560 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  40.96 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  35.14 
 
 		 559 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  41.03 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  31.01 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  30.48 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  32.99 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  35.54 
 
 		 546 aa  55.1  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  32.63 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  31.71 
 
 		 528 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  30.7 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  30.7 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  30.7 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  32.79 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  32.79 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  27.83 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  30.7 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  30.7 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 		 588 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  30.7 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  30.7 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  29.06 
 
 		 544 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 		 605 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  29.52 
 
 		 124 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  28.69 
 
 		 127 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  28.21 
 
 		 547 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  29.13 
 
 		 124 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.63 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 613 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  29.82 
 
 		 124 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  30.3 
 
 		 120 aa  52  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  29.13 
 
 		 124 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  29.13 
 
 		 124 aa  52  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  34.29 
 
 		 593 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  35.34 
 
 		 126 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5431  copper resistance protein CopC  28.71 
 
 		 106 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  33.6 
 
 		 128 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  30.7 
 
 		 137 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  31.16 
 
 		 424 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  27.35 
 
 		 547 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  30.16 
 
 		 124 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  27.84 
 
 		 126 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>