172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2634 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 173 aa  350  8e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  71.6 
 
 		 172 aa  235  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  38.07 
 
 		 173 aa  100  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  44.34 
 
 		 590 aa  78.6  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  38.6 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  35.59 
 
 		 122 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  35.59 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  34.72 
 
 		 613 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  43.01 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  41.94 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 663 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  37.72 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  41.67 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  34.88 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  40.78 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  30.67 
 
 		 565 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  34.38 
 
 		 544 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  34.38 
 
 		 544 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  29.37 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  33.87 
 
 		 544 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  30.64 
 
 		 564 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  34.88 
 
 		 549 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  31.07 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  36.04 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  33.59 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  36.13 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  36.13 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  35.04 
 
 		 549 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  33.87 
 
 		 547 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  37.86 
 
 		 547 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  33.87 
 
 		 547 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.6 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  35.45 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  30.1 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1603  copper resistance protein CopC  36.51 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.561066 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  35.2 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  33.81 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  31.36 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  31.36 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  31.36 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  31 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  31.36 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  31.13 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  31.36 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  31.36 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  32.23 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.36 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  29.41 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 		 869 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  32 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  34.91 
 
 		 160 aa  62  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  30.51 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  32.71 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  32.69 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  32.69 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  32.69 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  31.07 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  32.04 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 559 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.8 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  31.07 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  33.98 
 
 		 539 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  29.41 
 
 		 927 aa  58.2  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 546 aa  57.8  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  31.73 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  31 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  31 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  31 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  31.09 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  32.77 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  29 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  35.11 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  30.16 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  29 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  30.16 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  30.93 
 
 		 578 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  33.94 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 513 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  33.93 
 
 		 576 aa  54.7  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  29.58 
 
 		 560 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>