96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5834 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  33.33 
 
 		 125 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  34.91 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  36.46 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.62 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  34.41 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  28 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  28 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  26.89 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  28 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  34.15 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  29.31 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  29.31 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  32.69 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  37.18 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  37.18 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  31.53 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  31.53 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.53 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  31.53 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  31.53 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  31.53 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  33.01 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  31.9 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  34.74 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  35.79 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  35.79 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  30.63 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  34.74 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  31.07 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  28.7 
 
 		 590 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  28.89 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  32.61 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  32.93 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  29.66 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  27.5 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  51.52 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  27.97 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  28.7 
 
 		 120 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  32.58 
 
 		 632 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  27.5 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  31.43 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  30.43 
 
 		 565 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  30.3 
 
 		 559 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  28.18 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  29.21 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  29.29 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  30.43 
 
 		 564 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  28.89 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  29.13 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  31.09 
 
 		 571 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  28.89 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  28.89 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  21.31 
 
 		 544 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  34.41 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  29.2 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0809  copper resistance protein CopC  27.03 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 207 aa  43.5  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0808  hypothetical protein  32.43 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  21.31 
 
 		 544 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  21.43 
 
 		 547 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  29.31 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.03 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  28.1 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  21.31 
 
 		 549 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  32.5 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  20.49 
 
 		 547 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  31.03 
 
 		 208 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 225 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  20.49 
 
 		 547 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  20.49 
 
 		 549 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5818  copper resistance protein CopC  31.08 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0726843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  19.64 
 
 		 544 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  24.04 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  19.64 
 
 		 544 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  29.47 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  27.87 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  28 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  29.47 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1875  copper resistance protein CopC  28.95 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  32.93 
 
 		 193 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2486  copper resistance protein CopC  28.95 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.509116  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  26.44 
 
 		 121 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>