95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0251 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 140 aa  285  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  95.71 
 
 		 140 aa  273  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  72.17 
 
 		 149 aa  173  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 		 132 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00388  putative copper resistance (CopC-like) protein  35.04 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  33 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5834  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0327152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  31.09 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  33.96 
 
 		 519 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  28.69 
 
 		 528 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  28.97 
 
 		 513 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  30.4 
 
 		 590 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  31.25 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  29.36 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 241 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  28.83 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  26.85 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  27.12 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  30.63 
 
 		 125 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  28.83 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  28.83 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  29.36 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  27.52 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  27.52 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  28.83 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  28.57 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  27.52 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  28.83 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  30.39 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  30.39 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  30.39 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  28.7 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  29.36 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  30.83 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  28.95 
 
 		 576 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1977  hypothetical protein  25.44 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  27.93 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 564 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  27.78 
 
 		 565 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  29.17 
 
 		 210 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  28.1 
 
 		 233 aa  47.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  31.43 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  27.36 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  30.71 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  31.82 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  27.88 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  31.43 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  24.14 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  33.33 
 
 		 512 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  27.36 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  27.36 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  27.36 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  27.68 
 
 		 593 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  26.96 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 208 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 141 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  29.7 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  26.55 
 
 		 197 aa  43.9  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  32.11 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  28.12 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  28.85 
 
 		 214 aa  43.9  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  29.9 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  32.71 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  30 
 
 		 539 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  28.12 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  32.71 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  32.71 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  25.87 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  26.77 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  28.87 
 
 		 559 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  28.71 
 
 		 632 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  28.43 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.05 
 
 		 613 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  29.55 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  30.17 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5431  copper resistance protein CopC  25.71 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  28.21 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  29.55 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 		 173 aa  40.4  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  28.72 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  29.46 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  23.89 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  27.62 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  26.96 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>