103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  100 
 
 
197 aa  387  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  45.41 
 
 
188 aa  148  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  47.72 
 
 
182 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  46.67 
 
 
210 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  38.19 
 
 
208 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  47.2 
 
 
172 aa  94.7  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  44.74 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  33.17 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  36.5 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  42.64 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  36.26 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  45.45 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  40.32 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  37.69 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  46.94 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  43.96 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  38.73 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  42.42 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  30.69 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  35.56 
 
 
869 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  32.57 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  33.14 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  33.14 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.79 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  35.16 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  36.69 
 
 
211 aa  72  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  41.35 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  41.24 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  38.66 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  39.39 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  38.61 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  38.61 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  39.39 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  40.95 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  36.8 
 
 
528 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  45.37 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.89 
 
 
214 aa  64.7  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  41.18 
 
 
607 aa  63.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  35.38 
 
 
559 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  35.59 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  40.24 
 
 
206 aa  62.8  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  30 
 
 
544 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  30 
 
 
544 aa  62.4  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 
605 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 
197 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  41.18 
 
 
551 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  31.2 
 
 
547 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  30 
 
 
547 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  30.53 
 
 
547 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.33 
 
 
549 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  31.79 
 
 
173 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  31.2 
 
 
544 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  30 
 
 
549 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  29.33 
 
 
544 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  36.29 
 
 
118 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  35.19 
 
 
424 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  37.1 
 
 
578 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 
590 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  30.33 
 
 
141 aa  54.7  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  30.33 
 
 
141 aa  54.7  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  29.45 
 
 
565 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  37.74 
 
 
519 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  39.78 
 
 
649 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 
126 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  29.45 
 
 
564 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  31.53 
 
 
560 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 
119 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  41.24 
 
 
217 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  32.63 
 
 
193 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  35.35 
 
 
593 aa  51.6  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  30.77 
 
 
576 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.15 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.37 
 
 
613 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  31.37 
 
 
144 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  33.57 
 
 
571 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  28.93 
 
 
120 aa  48.5  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  28.07 
 
 
128 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  28.07 
 
 
128 aa  48.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  28.07 
 
 
128 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  36.89 
 
 
512 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  32.35 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  28.35 
 
 
173 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 
124 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  31.07 
 
 
588 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.8 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  30.97 
 
 
125 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  45.33 
 
 
697 aa  45.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  29.52 
 
 
137 aa  45.1  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  30.1 
 
 
539 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  29.85 
 
 
513 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  25.81 
 
 
127 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
546 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  29.17 
 
 
126 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5431  copper resistance protein CopC  28.28 
 
 
106 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  31.15 
 
 
126 aa  41.6  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  29 
 
 
126 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  29 
 
 
126 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>