186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0419 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 576 aa  1092    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  45.29 
 
 		 528 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  43.58 
 
 		 519 aa  324  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  42.75 
 
 		 512 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  40.34 
 
 		 539 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  38.19 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  29.59 
 
 		 565 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  29.64 
 
 		 564 aa  118  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  28.44 
 
 		 560 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 578 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  23.69 
 
 		 544 aa  100  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  24.43 
 
 		 549 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  23.94 
 
 		 544 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  23.86 
 
 		 544 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  23.86 
 
 		 544 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  26.04 
 
 		 547 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  25.25 
 
 		 547 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  23.76 
 
 		 549 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  25.78 
 
 		 547 aa  88.2  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  26.36 
 
 		 649 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  39.86 
 
 		 288 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  29.44 
 
 		 577 aa  77.8  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  26.84 
 
 		 663 aa  76.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  23.52 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  31.49 
 
 		 687 aa  72.8  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  26.27 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  30.53 
 
 		 551 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  25.04 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  29.73 
 
 		 607 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  40.78 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  38.61 
 
 		 244 aa  67  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  38.06 
 
 		 302 aa  67  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  29.87 
 
 		 718 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  36.13 
 
 		 869 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  32.8 
 
 		 686 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  37.04 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  36.73 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  40.5 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0498  copper resistance D domain-containing protein  35.4 
 
 		 300 aa  63.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  36.97 
 
 		 208 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  32.85 
 
 		 692 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  33.62 
 
 		 125 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  33.95 
 
 		 678 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  35.06 
 
 		 697 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  34.91 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  28.09 
 
 		 651 aa  61.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  38.71 
 
 		 241 aa  60.1  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  38.24 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  30.72 
 
 		 184 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  29.17 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  32.79 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  31.82 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.9 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  31.48 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  35.45 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  37.61 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  39.81 
 
 		 125 aa  57  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  35.9 
 
 		 225 aa  57  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  36.43 
 
 		 199 aa  57  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  32.14 
 
 		 149 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  36.51 
 
 		 226 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  32.05 
 
 		 304 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  37.76 
 
 		 119 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  39.09 
 
 		 122 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 173 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  38.18 
 
 		 708 aa  54.7  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  30.77 
 
 		 718 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  37.96 
 
 		 207 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  31.17 
 
 		 664 aa  54.3  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  34.51 
 
 		 229 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  34.34 
 
 		 226 aa  53.9  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  34.78 
 
 		 180 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  36.94 
 
 		 128 aa  53.5  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 124 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  28.66 
 
 		 309 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  38.33 
 
 		 197 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 588 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  30.19 
 
 		 687 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  29.69 
 
 		 206 aa  51.6  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  40.82 
 
 		 284 aa  51.6  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  35.54 
 
 		 722 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 174 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  34.03 
 
 		 571 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  22.18 
 
 		 927 aa  51.6  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  30.77 
 
 		 197 aa  51.2  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  33.07 
 
 		 189 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 217 aa  50.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 		 174 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 		 174 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  34.45 
 
 		 170 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 172 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  32.8 
 
 		 303 aa  50.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 		 196 aa  50.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  28.86 
 
 		 290 aa  50.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 223 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.06 
 
 		 731 aa  50.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 125 aa  49.7  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  38.39 
 
 		 129 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  27.06 
 
 		 613 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>