124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1652 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 927 aa  1853    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  23.39 
 
 		 613 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  22.77 
 
 		 663 aa  111  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  25.97 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  26.83 
 
 		 657 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  26.48 
 
 		 657 aa  101  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  26.48 
 
 		 657 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  26.48 
 
 		 657 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  26.48 
 
 		 657 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  26.48 
 
 		 657 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  26.48 
 
 		 657 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  22.86 
 
 		 560 aa  95.1  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  23.36 
 
 		 564 aa  92.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  24.46 
 
 		 544 aa  92  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  24.3 
 
 		 544 aa  91.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  22.13 
 
 		 559 aa  91.3  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  25.79 
 
 		 416 aa  91.3  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  25.86 
 
 		 326 aa  91.3  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  24.3 
 
 		 549 aa  89  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  28.98 
 
 		 302 aa  88.2  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  24.39 
 
 		 544 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  24.39 
 
 		 544 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  20.61 
 
 		 590 aa  87  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  28.39 
 
 		 332 aa  86.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  23.92 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  24.11 
 
 		 549 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  25.04 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  23.27 
 
 		 335 aa  84  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  23.66 
 
 		 547 aa  84  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  26.38 
 
 		 328 aa  82.8  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  21.36 
 
 		 697 aa  81.3  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  27.87 
 
 		 296 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  23.91 
 
 		 331 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  26.59 
 
 		 377 aa  77.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  23.94 
 
 		 571 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  23.73 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  27.62 
 
 		 280 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  27.62 
 
 		 280 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  27.62 
 
 		 280 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  25.82 
 
 		 299 aa  73.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.46 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  25 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  22.46 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  22.81 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  25.79 
 
 		 299 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  27.41 
 
 		 368 aa  70.1  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  25.7 
 
 		 364 aa  70.1  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  24.43 
 
 		 392 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  23.76 
 
 		 649 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  26.94 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  22.03 
 
 		 316 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  25.26 
 
 		 439 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  26.18 
 
 		 290 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  29.03 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  21.15 
 
 		 551 aa  64.3  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  26.58 
 
 		 316 aa  63.9  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  23.97 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  24.21 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  29.8 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.82 
 
 		 1505 aa  61.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  22.78 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  32.99 
 
 		 577 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 173 aa  58.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  21.45 
 
 		 528 aa  57.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  24.71 
 
 		 310 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 869 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  24.8 
 
 		 285 aa  55.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  23.59 
 
 		 1557 aa  55.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  21.72 
 
 		 578 aa  55.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  24.11 
 
 		 307 aa  54.7  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  28.76 
 
 		 172 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  22.85 
 
 		 305 aa  54.3  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  23.35 
 
 		 621 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  28.74 
 
 		 1024 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  20.18 
 
 		 546 aa  53.1  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  25 
 
 		 1347 aa  52.8  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  21.39 
 
 		 359 aa  52.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  26.52 
 
 		 310 aa  52  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  23.1 
 
 		 1397 aa  52  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  23.56 
 
 		 308 aa  51.6  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  28.65 
 
 		 173 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1014  NHL repeat containing protein  21.33 
 
 		 444 aa  51.2  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00195026  normal  0.319723 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  22.55 
 
 		 309 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1608 aa  50.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02040  gluconolactonase  25.66 
 
 		 298 aa  50.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  27.64 
 
 		 226 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  25.12 
 
 		 1278 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  20.16 
 
 		 607 aa  48.9  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  22.97 
 
 		 294 aa  48.9  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  24.11 
 
 		 1114 aa  48.5  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  29.52 
 
 		 144 aa  48.1  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  24.01 
 
 		 303 aa  48.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  22.39 
 
 		 294 aa  48.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  24.9 
 
 		 1414 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  27.23 
 
 		 287 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  21.36 
 
 		 291 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  21.84 
 
 		 291 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  21.84 
 
 		 291 aa  47.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 		 126 aa  47.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  23.91 
 
 		 1374 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>