202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3065 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 578 aa  1122    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  47.35 
 
 		 564 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  47.27 
 
 		 565 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  46.89 
 
 		 560 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  37.84 
 
 		 559 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  35.42 
 
 		 649 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  33.46 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  30.24 
 
 		 577 aa  147  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  24.46 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  24.28 
 
 		 547 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  24.46 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  31.68 
 
 		 607 aa  144  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  25.41 
 
 		 544 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  24.77 
 
 		 544 aa  143  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  24.91 
 
 		 549 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  24.54 
 
 		 547 aa  140  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  26.11 
 
 		 547 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  25.59 
 
 		 549 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  27.47 
 
 		 590 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 		 546 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  25.29 
 
 		 613 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  28.37 
 
 		 528 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  24.82 
 
 		 663 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  37.18 
 
 		 605 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  27.49 
 
 		 519 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  27.97 
 
 		 571 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  29.59 
 
 		 512 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  29.15 
 
 		 539 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  27.82 
 
 		 869 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  41.61 
 
 		 593 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  22.94 
 
 		 927 aa  88.6  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  23.08 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  35.32 
 
 		 588 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  41.46 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  41.46 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  40.65 
 
 		 174 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  37.27 
 
 		 576 aa  80.1  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  37.19 
 
 		 188 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  36.03 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  28.19 
 
 		 697 aa  73.6  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  34.07 
 
 		 210 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  28.63 
 
 		 632 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  35.2 
 
 		 173 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  38.89 
 
 		 180 aa  72  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  33.06 
 
 		 124 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  44.12 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  44 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  34.78 
 
 		 172 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  40.59 
 
 		 178 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  38.21 
 
 		 208 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.72 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 		 126 aa  68.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  38.24 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  31.4 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  33.6 
 
 		 203 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  29.2 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  34.92 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  34.92 
 
 		 141 aa  65.1  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  41.11 
 
 		 184 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  31.4 
 
 		 124 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  32.56 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27.75 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  27.78 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  31.41 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  32.26 
 
 		 310 aa  63.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 244 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  34.44 
 
 		 189 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  31 
 
 		 121 aa  62  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  35.25 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  28.23 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  28.23 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  28.23 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.75 
 
 		 208 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  34.43 
 
 		 223 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  28.32 
 
 		 124 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  34.43 
 
 		 170 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  33.62 
 
 		 197 aa  59.3  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 124 aa  58.9  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.29 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  35.48 
 
 		 691 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  33.66 
 
 		 119 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  28.85 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  28.85 
 
 		 124 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  32.17 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  28.85 
 
 		 124 aa  58.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  29.2 
 
 		 686 aa  57.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1130  copper resistance protein CopC  36.46 
 
 		 132 aa  57.8  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0394457  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  32.19 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  28.35 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 226 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  30.52 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>