128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3717 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  57.16 
 
 
697 aa  695    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  82.75 
 
 
718 aa  1167    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  100 
 
 
718 aa  1414    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  50.07 
 
 
752 aa  633  1e-180  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  46.44 
 
 
708 aa  533  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  48.22 
 
 
722 aa  527  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  42.86 
 
 
687 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  46.3 
 
 
683 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  52.09 
 
 
671 aa  455  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  42.41 
 
 
711 aa  445  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  41.05 
 
 
631 aa  442  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  38 
 
 
739 aa  432  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  40.97 
 
 
708 aa  414  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  40.66 
 
 
678 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  39.73 
 
 
665 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  39.73 
 
 
665 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  39.73 
 
 
665 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  41.39 
 
 
692 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  39.3 
 
 
664 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  36.14 
 
 
691 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  37.8 
 
 
681 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  38.28 
 
 
687 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.58 
 
 
731 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  40.34 
 
 
686 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  37.04 
 
 
651 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.59 
 
 
675 aa  364  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  43.43 
 
 
653 aa  360  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  38.22 
 
 
671 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  36.93 
 
 
736 aa  353  5.9999999999999994e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  40.09 
 
 
676 aa  333  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  37.96 
 
 
719 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  40.62 
 
 
672 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  36.7 
 
 
651 aa  313  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  39.92 
 
 
679 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  34.68 
 
 
646 aa  268  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  33.95 
 
 
632 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  35.12 
 
 
641 aa  260  7e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  35.12 
 
 
641 aa  260  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  34.8 
 
 
642 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  41.53 
 
 
661 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  33.84 
 
 
637 aa  253  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.58 
 
 
319 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  40.4 
 
 
310 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  42.81 
 
 
319 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  40.14 
 
 
322 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.48 
 
 
654 aa  178  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  37.1 
 
 
322 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  33.22 
 
 
328 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.2 
 
 
613 aa  159  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  35.97 
 
 
326 aa  154  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  35.97 
 
 
331 aa  153  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  35.97 
 
 
331 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  35.61 
 
 
331 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  36.2 
 
 
308 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  31.73 
 
 
651 aa  150  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  34.07 
 
 
322 aa  143  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  33.68 
 
 
327 aa  124  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.42 
 
 
307 aa  122  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  30.33 
 
 
604 aa  122  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  30 
 
 
394 aa  114  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  26.69 
 
 
265 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  26.89 
 
 
274 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  28.9 
 
 
354 aa  100  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  26.59 
 
 
277 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  26.59 
 
 
277 aa  99  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  28.33 
 
 
387 aa  97.8  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  26.97 
 
 
277 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  26.59 
 
 
277 aa  97.4  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.47 
 
 
326 aa  93.6  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  30.17 
 
 
273 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  28.09 
 
 
343 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  28.57 
 
 
254 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  29.67 
 
 
343 aa  80.1  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  28.7 
 
 
315 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  29.29 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  29.05 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.74 
 
 
246 aa  65.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  28.64 
 
 
270 aa  63.9  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  27.49 
 
 
319 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  29.59 
 
 
322 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.16 
 
 
291 aa  61.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  28.83 
 
 
578 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  26.75 
 
 
267 aa  55.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  27.83 
 
 
328 aa  55.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  26.48 
 
 
313 aa  55.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  25.2 
 
 
300 aa  54.7  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  23.33 
 
 
544 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  34.69 
 
 
277 aa  53.9  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  26.73 
 
 
289 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  27 
 
 
265 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3086  hypothetical protein  30.67 
 
 
235 aa  52.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0589331  hitchhiker  0.00886483 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  26.85 
 
 
332 aa  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  22.92 
 
 
439 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  22.58 
 
 
309 aa  51.2  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  23.33 
 
 
547 aa  50.8  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  24.17 
 
 
549 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  22.92 
 
 
547 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  24.51 
 
 
544 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  26.39 
 
 
649 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  26.24 
 
 
309 aa  49.3  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>