67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2207 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  752    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  34.14 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  34.05 
 
 		 679 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  31.56 
 
 		 651 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  35.88 
 
 		 322 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  30.98 
 
 		 691 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  28.81 
 
 		 661 aa  133  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  28 
 
 		 678 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  32.99 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  29.49 
 
 		 681 aa  126  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  34.77 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  30.3 
 
 		 739 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.77 
 
 		 731 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  33 
 
 		 665 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  33 
 
 		 665 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  33 
 
 		 665 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  29.04 
 
 		 664 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  30.62 
 
 		 651 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  30.26 
 
 		 631 aa  116  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  32.31 
 
 		 722 aa  113  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  28.33 
 
 		 718 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  28.12 
 
 		 719 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  30.7 
 
 		 736 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  26.76 
 
 		 752 aa  110  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  30.74 
 
 		 672 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.11 
 
 		 683 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  24.92 
 
 		 692 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  29.54 
 
 		 687 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.38 
 
 		 654 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  30.65 
 
 		 676 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.63 
 
 		 613 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.1 
 
 		 675 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  29.45 
 
 		 697 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  29.09 
 
 		 632 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  27.67 
 
 		 718 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  26.76 
 
 		 708 aa  100  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  27.95 
 
 		 686 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  30.68 
 
 		 711 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  29.07 
 
 		 708 aa  89.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  28.47 
 
 		 671 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.97 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  25.54 
 
 		 687 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  28.19 
 
 		 671 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  28.79 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  25.54 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  25.54 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  25.54 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  22.22 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  37.31 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  27 
 
 		 651 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  24.91 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  21.69 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  27.32 
 
 		 327 aa  59.3  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.71 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  32.81 
 
 		 646 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.8 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  30.38 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  24.09 
 
 		 637 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  24.09 
 
 		 641 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  24.09 
 
 		 641 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  26.5 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  22.54 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  26.74 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  22.13 
 
 		 277 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  22.13 
 
 		 277 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  21.51 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  28.24 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>