114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21870 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  100 
 
 		 671 aa  1299    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  42.44 
 
 		 708 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  40.75 
 
 		 631 aa  369  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  37.75 
 
 		 718 aa  364  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  36.44 
 
 		 718 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  40.83 
 
 		 722 aa  348  1e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  45.07 
 
 		 671 aa  343  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  38.66 
 
 		 708 aa  318  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  36.7 
 
 		 687 aa  314  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  35.66 
 
 		 697 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  37.88 
 
 		 739 aa  303  8.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  37.66 
 
 		 752 aa  302  1e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  40.92 
 
 		 686 aa  302  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  38.05 
 
 		 711 aa  295  2e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  38.74 
 
 		 665 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  38.74 
 
 		 665 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  38.74 
 
 		 665 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.2 
 
 		 675 aa  289  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  39.42 
 
 		 692 aa  286  8e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  42.89 
 
 		 651 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  42.03 
 
 		 679 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  35.51 
 
 		 651 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  40.7 
 
 		 681 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  38.84 
 
 		 687 aa  281  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  40.82 
 
 		 678 aa  281  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.18 
 
 		 731 aa  278  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  39.26 
 
 		 664 aa  277  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  37.81 
 
 		 691 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.88 
 
 		 683 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  37.22 
 
 		 719 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  41.4 
 
 		 672 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  34.97 
 
 		 736 aa  231  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  36.67 
 
 		 676 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  35.18 
 
 		 632 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  36.82 
 
 		 661 aa  181  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.89 
 
 		 319 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  30.06 
 
 		 642 aa  164  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  38.97 
 
 		 319 aa  157  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  29.65 
 
 		 641 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  29.65 
 
 		 641 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.31 
 
 		 654 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  29.85 
 
 		 637 aa  147  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  28.84 
 
 		 646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  31.11 
 
 		 328 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  31.16 
 
 		 310 aa  131  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  32.77 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  28.19 
 
 		 653 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  33 
 
 		 331 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  33 
 
 		 331 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  33 
 
 		 326 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  32.67 
 
 		 331 aa  126  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  33.45 
 
 		 308 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  31.83 
 
 		 322 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.33 
 
 		 613 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  32.09 
 
 		 322 aa  114  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  31.82 
 
 		 651 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  26.84 
 
 		 327 aa  101  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.98 
 
 		 307 aa  94.7  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  34.78 
 
 		 273 aa  82.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  26.35 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  27.99 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  30.89 
 
 		 604 aa  72.4  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  28.18 
 
 		 254 aa  69.7  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  27.09 
 
 		 354 aa  63.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.84 
 
 		 326 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  28.86 
 
 		 300 aa  62  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  32.9 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  27.32 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  31.9 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  32.48 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  26.8 
 
 		 265 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  25.77 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  25.77 
 
 		 277 aa  58.9  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  25.99 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  28.92 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  28.51 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 613 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  29.63 
 
 		 267 aa  56.6  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  25.26 
 
 		 277 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  25.26 
 
 		 277 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  35.45 
 
 		 547 aa  55.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.08 
 
 		 309 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  34.38 
 
 		 439 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  35.48 
 
 		 544 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  35.48 
 
 		 544 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  35.48 
 
 		 544 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  35.48 
 
 		 544 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 551 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  35.48 
 
 		 549 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  35.48 
 
 		 547 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  35.9 
 
 		 400 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.09 
 
 		 564 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.54 
 
 		 565 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  34.41 
 
 		 547 aa  52  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3086  hypothetical protein  33.71 
 
 		 235 aa  51.2  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0589331  hitchhiker  0.00886483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  29.33 
 
 		 571 aa  51.2  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 549 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 869 aa  50.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  34.38 
 
 		 588 aa  50.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  30.14 
 
 		 316 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>