94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5328 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  95.45 
 
 		 637 aa  1131    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 641 aa  1242    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  93.46 
 
 		 642 aa  1137    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  88.63 
 
 		 646 aa  1064    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 641 aa  1242    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  58.47 
 
 		 665 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  58.31 
 
 		 665 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  58.31 
 
 		 665 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  56.37 
 
 		 676 aa  594  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  57.03 
 
 		 672 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  43.46 
 
 		 651 aa  477  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  43.91 
 
 		 675 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  44.48 
 
 		 687 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  41.18 
 
 		 686 aa  352  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  37.01 
 
 		 678 aa  321  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  35.26 
 
 		 692 aa  302  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  35.01 
 
 		 664 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  37.22 
 
 		 651 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.46 
 
 		 731 aa  279  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  34.24 
 
 		 681 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  34.09 
 
 		 691 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  35.56 
 
 		 679 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  36.72 
 
 		 718 aa  263  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  34.37 
 
 		 718 aa  261  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  36.69 
 
 		 632 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  35.67 
 
 		 739 aa  248  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  38.64 
 
 		 671 aa  247  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  35.32 
 
 		 708 aa  246  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  35.87 
 
 		 722 aa  237  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  32.86 
 
 		 736 aa  231  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  32.46 
 
 		 697 aa  223  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  30.92 
 
 		 687 aa  220  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  32.82 
 
 		 631 aa  220  7e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  32.5 
 
 		 708 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  31.91 
 
 		 752 aa  214  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.03 
 
 		 613 aa  209  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  33.11 
 
 		 719 aa  209  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  41.18 
 
 		 661 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.7 
 
 		 683 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.35 
 
 		 654 aa  168  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  36.56 
 
 		 651 aa  167  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  30.03 
 
 		 671 aa  157  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  33.87 
 
 		 711 aa  156  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  30.69 
 
 		 653 aa  139  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  34.92 
 
 		 319 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.33 
 
 		 319 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  31.8 
 
 		 322 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  31.25 
 
 		 328 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  31.75 
 
 		 322 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  30.43 
 
 		 310 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  30.08 
 
 		 308 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  29.96 
 
 		 331 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  29.96 
 
 		 331 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  30.08 
 
 		 331 aa  92  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  30.08 
 
 		 326 aa  92  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  27.8 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  32.69 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  30.33 
 
 		 604 aa  72.8  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  27.17 
 
 		 254 aa  72.8  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  27.76 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  29.61 
 
 		 322 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.04 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  34.97 
 
 		 273 aa  66.6  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  27.97 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.23 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  30.74 
 
 		 339 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  27.81 
 
 		 327 aa  55.5  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  26.09 
 
 		 265 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  26.09 
 
 		 274 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  31.05 
 
 		 559 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  26.09 
 
 		 277 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  24.86 
 
 		 544 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.09 
 
 		 613 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  24.86 
 
 		 549 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  23.77 
 
 		 387 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 		 547 aa  48.9  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  23.53 
 
 		 277 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.16 
 
 		 246 aa  48.5  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  23.53 
 
 		 277 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  26.77 
 
 		 439 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  26.77 
 
 		 544 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.68 
 
 		 544 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.68 
 
 		 544 aa  47.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  28.44 
 
 		 528 aa  47.4  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  25.22 
 
 		 290 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  25.12 
 
 		 277 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  25.7 
 
 		 547 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  37.25 
 
 		 588 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  26.77 
 
 		 549 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0583  membrane protein  26.62 
 
 		 275 aa  45.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.7411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  25.98 
 
 		 547 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  26.1 
 
 		 290 aa  44.7  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  26.1 
 
 		 290 aa  44.7  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  32.82 
 
 		 400 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>