94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1987 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  100 
 
 
354 aa  702    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  43.92 
 
 
394 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.58 
 
 
326 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  36.18 
 
 
736 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  36.57 
 
 
310 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  35.82 
 
 
651 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  32.22 
 
 
691 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  30.59 
 
 
681 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  35.82 
 
 
679 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  30.64 
 
 
752 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  29.88 
 
 
692 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  31.83 
 
 
719 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  30.92 
 
 
687 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  29.78 
 
 
718 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  29.48 
 
 
718 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  32.47 
 
 
722 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  30.74 
 
 
678 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  36.57 
 
 
322 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  33.73 
 
 
328 aa  123  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  29.36 
 
 
661 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  35.21 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  30.14 
 
 
664 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  34.8 
 
 
711 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.14 
 
 
683 aa  115  8.999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.92 
 
 
731 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  31.14 
 
 
651 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  34.19 
 
 
671 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  30.29 
 
 
686 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  31.39 
 
 
676 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  31.81 
 
 
697 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  30.53 
 
 
665 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  30.53 
 
 
665 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  30.53 
 
 
665 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  29.07 
 
 
739 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.05 
 
 
675 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  31.39 
 
 
672 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  28.53 
 
 
708 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.89 
 
 
654 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  29.39 
 
 
331 aa  102  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  29.39 
 
 
331 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  29.02 
 
 
326 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  30.89 
 
 
327 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  30.57 
 
 
632 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.26 
 
 
307 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  29.71 
 
 
308 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  28.39 
 
 
331 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  29.71 
 
 
708 aa  97.1  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  27.54 
 
 
631 aa  97.1  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  32.14 
 
 
319 aa  96.3  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  29.89 
 
 
646 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  28.25 
 
 
687 aa  93.6  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  31.28 
 
 
315 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  29.12 
 
 
264 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  28.49 
 
 
671 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  28.11 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  28.74 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  28.19 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  27.8 
 
 
641 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  27.8 
 
 
641 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.06 
 
 
613 aa  83.2  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  27.61 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.39 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  26.16 
 
 
637 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  28.57 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  28.57 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  27.23 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  27.68 
 
 
277 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.89 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  27.68 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  30.29 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  26.79 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  30.21 
 
 
651 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  29.68 
 
 
387 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  30.52 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  28.7 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.38 
 
 
290 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  30.29 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  25.38 
 
 
274 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  29.66 
 
 
298 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  29.19 
 
 
328 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  30.21 
 
 
273 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.86 
 
 
246 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  29.22 
 
 
317 aa  57  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  25 
 
 
300 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  25.12 
 
 
322 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  24.24 
 
 
289 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  25.14 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  26.64 
 
 
300 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  23.49 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  28.06 
 
 
653 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  24.63 
 
 
296 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  23.93 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.62 
 
 
283 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  23.67 
 
 
327 aa  43.5  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>