96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5241 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  100 
 
 		 300 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  48.86 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  50.18 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  48.24 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  44.93 
 
 		 328 aa  205  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  40.8 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  43.15 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  40.08 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  37.1 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  40.77 
 
 		 332 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  31.82 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  31.05 
 
 		 265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  32.6 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.05 
 
 		 309 aa  99.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  33.21 
 
 		 271 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  32.68 
 
 		 255 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  30 
 
 		 267 aa  92.8  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  45.3 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  27.94 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  27.57 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  29.08 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  27.92 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  27.92 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  27.92 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  27.92 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  27.92 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  27.92 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  27.92 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  32.23 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  31.54 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  27.52 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  27.57 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  27.82 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  26.67 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  27.64 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  32.04 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  27.92 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  27.94 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.67 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  27.94 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  28.21 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  27.94 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.94 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  27.94 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  28.74 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.85 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  24.8 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3120  hypothetical protein  27.32 
 
 		 209 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  27.17 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0855  hypothetical protein  30.77 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2514  hypothetical protein  30.89 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  25.5 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.65 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  24.68 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  24.68 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  24.44 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  24.57 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  23.96 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  24.57 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  31.58 
 
 		 265 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  31.58 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  23.79 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  25.87 
 
 		 394 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  25.73 
 
 		 752 aa  50.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.31 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  30.83 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  30.83 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  30.83 
 
 		 277 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  31.58 
 
 		 274 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  24 
 
 		 280 aa  48.9  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  26.21 
 
 		 678 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.13 
 
 		 654 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  27.31 
 
 		 664 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  24.88 
 
 		 722 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0583  membrane protein  27.17 
 
 		 275 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.7411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  26.22 
 
 		 651 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  26.44 
 
 		 676 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  25 
 
 		 697 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2794  hypothetical protein  27.42 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132736  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  26.84 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  22.43 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2479  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.14 
 
 		 208 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  26.23 
 
 		 679 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  25.98 
 
 		 651 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  23.24 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3987  hypothetical protein  22.82 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  24.42 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  25.46 
 
 		 328 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  24.91 
 
 		 692 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  26.02 
 
 		 691 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3889  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  42.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31119  normal  0.156158 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  20.65 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  24.46 
 
 		 686 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  25.65 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1197  hypothetical protein  23.81 
 
 		 319 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4042  hypothetical protein  23.81 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>