73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11200 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  100 
 
 		 273 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  57.92 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  49.61 
 
 		 267 aa  248  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  36.67 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  37.33 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  39.06 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  39.93 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  42.22 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  41.18 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  37.67 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  38.1 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  40.35 
 
 		 317 aa  99  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  35.51 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  31.03 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  31.11 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  33.18 
 
 		 273 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  36.41 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  30.6 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  35.89 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.23 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  41.94 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  31.56 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  24.39 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  23.05 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2794  hypothetical protein  32.64 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132736  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  31.44 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  25.89 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.95 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  25 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3987  hypothetical protein  21.35 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1197  hypothetical protein  20.97 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4042  hypothetical protein  20.97 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388035  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  34.59 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3852  hypothetical protein  21.35 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3683  hypothetical protein  21.35 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4150  hypothetical protein  21.35 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3955  hypothetical protein  21.35 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3700  CtaG membrane protein  21.35 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  24.75 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  20.97 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  21.51 
 
 		 301 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  23.27 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.76 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  22.77 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3766  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  20 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  26.2 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  25.48 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  25.48 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  25.48 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  25.48 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  25.48 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  25.48 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  25.48 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3120  hypothetical protein  33.68 
 
 		 209 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  27.19 
 
 		 310 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  22.28 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  22.28 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  25.48 
 
 		 290 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  25.31 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  25.37 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  27.18 
 
 		 394 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.91 
 
 		 326 aa  47  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3889  hypothetical protein  30.3 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31119  normal  0.156158 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  26.32 
 
 		 671 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  29.23 
 
 		 651 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  27.49 
 
 		 687 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  26.67 
 
 		 752 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0855  hypothetical protein  31.53 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  25.31 
 
 		 651 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2514  hypothetical protein  32.12 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  29.46 
 
 		 679 aa  42.7  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  28.26 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>