133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4137 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  612  9.999999999999999e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  50.36 
 
 		 298 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  52.99 
 
 		 316 aa  231  9e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  51.08 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  51.19 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  45.85 
 
 		 328 aa  205  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  45.39 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  42.7 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  45.34 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  44.49 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  33.8 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  32.96 
 
 		 264 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.68 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  33.7 
 
 		 265 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 267 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.58 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  34.02 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  36.56 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  32.23 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.42 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 651 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  34.3 
 
 		 679 aa  97.1  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  28.9 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  27.48 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  27.48 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  27.48 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  27.48 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  27.48 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  27.48 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  26.67 
 
 		 289 aa  92.4  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  27.48 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  33.73 
 
 		 253 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  27.86 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  30.86 
 
 		 235 aa  89.7  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  40.85 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  34 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.16 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  28.74 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  32.82 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  30.95 
 
 		 752 aa  84.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  30.32 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  33.81 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  28.83 
 
 		 686 aa  80.5  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  32.55 
 
 		 671 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  27.88 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  31.71 
 
 		 722 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  28.93 
 
 		 687 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  24.81 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  28.47 
 
 		 672 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  29.63 
 
 		 394 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  27.78 
 
 		 681 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  26.37 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  27.46 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  29.78 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  27 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  28.7 
 
 		 718 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  26.62 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  30.08 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  27.5 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  30.32 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.21 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  27.85 
 
 		 691 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  29.08 
 
 		 678 aa  69.3  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.76 
 
 		 683 aa  69.3  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  28.4 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  30.39 
 
 		 711 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  26.27 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  27.65 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  27.65 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  29.6 
 
 		 676 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  26.88 
 
 		 661 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  27.65 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.44 
 
 		 675 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  23.44 
 
 		 280 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  21.8 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  28.08 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  28.08 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  28.08 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  27.34 
 
 		 692 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  30.43 
 
 		 697 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  28.91 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  25.53 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3987  hypothetical protein  22.49 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  25.21 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  25.88 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.47 
 
 		 731 aa  62.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  24.79 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2443  membrane protein-like protein  24.73 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3766  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  21.72 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  24.79 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  24.79 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  22.15 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1197  hypothetical protein  21.8 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2794  hypothetical protein  33.83 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.27 
 
 		 654 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  30.65 
 
 		 708 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4042  hypothetical protein  21.8 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.388035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  26.86 
 
 		 632 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3700  CtaG membrane protein  21.8 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>