39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2443 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2443  membrane protein-like protein  100 
 
 
287 aa  573  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348507  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.01 
 
 
307 aa  165  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  33.8 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  33.94 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  34.47 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  33.21 
 
 
290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  32.84 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  32.84 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  32.84 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  32.84 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  32.84 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  32.84 
 
 
290 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  35.64 
 
 
280 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  33.87 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  33.97 
 
 
274 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  33.83 
 
 
289 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  33.46 
 
 
290 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  33.09 
 
 
290 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  34.35 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  34.35 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  34.35 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  34.15 
 
 
289 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  24.07 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  25.53 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  24.27 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  24.37 
 
 
318 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  21.67 
 
 
316 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  22.88 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  22.05 
 
 
265 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  23.62 
 
 
300 aa  49.3  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  24.1 
 
 
678 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  22.63 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  21.77 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  23.95 
 
 
298 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  21.84 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  24.62 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  26.97 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.74 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.26 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>