98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5346 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  658    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  98.47 
 
 
326 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  99.7 
 
 
331 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  96.68 
 
 
331 aa  618  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  95.78 
 
 
308 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  62.21 
 
 
307 aa  352  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  48.75 
 
 
322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.91 
 
 
319 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  37.54 
 
 
319 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  38.36 
 
 
665 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  38.36 
 
 
665 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  38.36 
 
 
665 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  35.97 
 
 
718 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  31.62 
 
 
681 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  38.06 
 
 
692 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  35.05 
 
 
651 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  34.01 
 
 
661 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  36.69 
 
 
722 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.07 
 
 
675 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  36.73 
 
 
672 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  33.72 
 
 
719 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  32.65 
 
 
718 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  34.04 
 
 
736 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  38.28 
 
 
676 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  33.79 
 
 
678 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  35.71 
 
 
632 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  32.8 
 
 
686 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  32.73 
 
 
687 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  34.47 
 
 
739 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.07 
 
 
654 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.04 
 
 
731 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  32.78 
 
 
752 aa  132  7.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  33.45 
 
 
697 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  33.77 
 
 
651 aa  129  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  35.52 
 
 
671 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  33 
 
 
671 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  33.12 
 
 
679 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  30.52 
 
 
691 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  29.51 
 
 
322 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  32.71 
 
 
664 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  31.23 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  33.22 
 
 
708 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  28.83 
 
 
310 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  31.48 
 
 
708 aa  116  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  32.62 
 
 
711 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  28.66 
 
 
631 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.64 
 
 
613 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  27.47 
 
 
322 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.34 
 
 
683 aa  106  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  31.94 
 
 
687 aa  97.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  30.34 
 
 
646 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  29.89 
 
 
641 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  29.89 
 
 
641 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  27.63 
 
 
394 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  29 
 
 
637 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  29.78 
 
 
642 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  28.71 
 
 
354 aa  89.4  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.3 
 
 
326 aa  86.3  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  29.92 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  22.34 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  29.44 
 
 
254 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  25 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  29.24 
 
 
651 aa  62.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.07 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  26.92 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  24.69 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  25.12 
 
 
332 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  25.51 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  28.14 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  23.1 
 
 
274 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  27.95 
 
 
264 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  23.22 
 
 
277 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.76 
 
 
290 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  23.22 
 
 
277 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  23.51 
 
 
265 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  25.54 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  26.88 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  24.68 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  22.83 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  28.03 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  26.12 
 
 
316 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  23.86 
 
 
296 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.5 
 
 
283 aa  53.1  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  22.73 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  26.94 
 
 
317 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  23.36 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  24.62 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  26.63 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3766  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  29.51 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  33.1 
 
 
301 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  31.03 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>