102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3296 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  634    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  80.12 
 
 		 322 aa  488  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  50.68 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  48.31 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  41.57 
 
 		 651 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  43.34 
 
 		 719 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  40.21 
 
 		 691 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  42.49 
 
 		 687 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  41 
 
 		 681 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  38.85 
 
 		 661 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  42.34 
 
 		 679 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  42.7 
 
 		 651 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  43.4 
 
 		 736 aa  192  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  39.25 
 
 		 718 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  43.6 
 
 		 678 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  35.19 
 
 		 752 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.07 
 
 		 731 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  38.75 
 
 		 665 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  37.9 
 
 		 718 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  38.75 
 
 		 665 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  38.75 
 
 		 665 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  40.26 
 
 		 722 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  41.03 
 
 		 664 aa  176  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  41.91 
 
 		 697 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  39.03 
 
 		 686 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  37 
 
 		 692 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  40.71 
 
 		 671 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  39.35 
 
 		 319 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  38.49 
 
 		 672 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  37.31 
 
 		 739 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  38.26 
 
 		 708 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  39.31 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.11 
 
 		 675 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  38.68 
 
 		 676 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.74 
 
 		 654 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  38.13 
 
 		 632 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  36.88 
 
 		 631 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  35.29 
 
 		 708 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  35.1 
 
 		 711 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.59 
 
 		 683 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  35.39 
 
 		 687 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  31.36 
 
 		 671 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  35.88 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  29.67 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  29.67 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  29.67 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  29.67 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  31.75 
 
 		 641 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  31.75 
 
 		 641 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 646 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  29.67 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  31.62 
 
 		 642 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  29.86 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.47 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  31.5 
 
 		 637 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.47 
 
 		 613 aa  112  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  37.13 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  31.32 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  36.1 
 
 		 651 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  28.96 
 
 		 394 aa  99.4  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  28.76 
 
 		 274 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  31.3 
 
 		 254 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  27.16 
 
 		 265 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  27.27 
 
 		 277 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  27.59 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  27.59 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  27.54 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  31.47 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.99 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  29.77 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.83 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  25.09 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  25.88 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  29.09 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  24.91 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.18 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  24.06 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  24.62 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  24.62 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  24.62 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  24.62 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  24.62 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  24.62 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.05 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  24.24 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  27.31 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  26.15 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  27.31 
 
 		 332 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  25.5 
 
 		 266 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  23.79 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  24.48 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  32.16 
 
 		 277 aa  49.7  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.25 
 
 		 290 aa  49.7  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  30.41 
 
 		 653 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  23.7 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  27.99 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  27.18 
 
 		 273 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  28.29 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  25 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  23.68 
 
 		 289 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>