138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_16830 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  100 
 
 		 708 aa  1387    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  50.7 
 
 		 671 aa  504  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  40.91 
 
 		 718 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  45.06 
 
 		 722 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  41.9 
 
 		 718 aa  446  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  40.48 
 
 		 739 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  44.58 
 
 		 631 aa  435  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  44.04 
 
 		 697 aa  432  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  41.55 
 
 		 651 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  40.97 
 
 		 708 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  41 
 
 		 752 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  42.72 
 
 		 687 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  43.17 
 
 		 671 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  40.12 
 
 		 678 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  40.92 
 
 		 687 aa  395  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  42.26 
 
 		 686 aa  390  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.41 
 
 		 675 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  39.91 
 
 		 692 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  41.21 
 
 		 665 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  41.21 
 
 		 665 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  41.05 
 
 		 665 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  42.61 
 
 		 711 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  45.44 
 
 		 683 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  40.21 
 
 		 664 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  41.73 
 
 		 681 aa  378  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  38.96 
 
 		 691 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  41.35 
 
 		 651 aa  356  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.76 
 
 		 731 aa  352  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  43.23 
 
 		 679 aa  348  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  41.41 
 
 		 672 aa  346  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  37.61 
 
 		 736 aa  335  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  40.92 
 
 		 676 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  37.31 
 
 		 719 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  35.22 
 
 		 642 aa  269  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  46.15 
 
 		 661 aa  264  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  34.9 
 
 		 637 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  34.68 
 
 		 646 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  35.66 
 
 		 641 aa  260  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  35.66 
 
 		 641 aa  260  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  38.14 
 
 		 632 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  43.88 
 
 		 319 aa  207  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  41.06 
 
 		 310 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  35.08 
 
 		 653 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  38.75 
 
 		 328 aa  191  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  43.79 
 
 		 319 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.93 
 
 		 654 aa  183  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  38.3 
 
 		 651 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  38.25 
 
 		 322 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  36.62 
 
 		 322 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  37.32 
 
 		 322 aa  150  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.07 
 
 		 613 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  35.62 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  35.49 
 
 		 326 aa  140  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  35.62 
 
 		 331 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  35.27 
 
 		 331 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  34.9 
 
 		 308 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.9 
 
 		 307 aa  123  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  30.77 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  30.94 
 
 		 394 aa  104  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.64 
 
 		 326 aa  98.6  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  32.8 
 
 		 343 aa  95.5  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  29.94 
 
 		 354 aa  92.4  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  29.64 
 
 		 387 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  37.5 
 
 		 273 aa  89.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  29.48 
 
 		 604 aa  88.6  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  32.6 
 
 		 254 aa  79  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  35.88 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  24.62 
 
 		 274 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  25.69 
 
 		 277 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  23.68 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  24.4 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  24.4 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  23.77 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  32.21 
 
 		 315 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  31.35 
 
 		 339 aa  67  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3086  hypothetical protein  37.2 
 
 		 235 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0589331  hitchhiker  0.00886483 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  28.84 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  28.28 
 
 		 322 aa  57  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  33.04 
 
 		 274 aa  55.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  27.74 
 
 		 270 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  37.7 
 
 		 291 aa  55.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  28.11 
 
 		 294 aa  54.7  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  25 
 
 		 296 aa  54.7  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  25.7 
 
 		 327 aa  53.5  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  27.1 
 
 		 294 aa  53.9  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  27.1 
 
 		 294 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  24.79 
 
 		 289 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  27.56 
 
 		 267 aa  53.9  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.91 
 
 		 307 aa  53.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.16 
 
 		 246 aa  52  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  33.54 
 
 		 551 aa  50.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  30.99 
 
 		 310 aa  50.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  27.09 
 
 		 332 aa  50.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  30.2 
 
 		 318 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  27.99 
 
 		 265 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  25.64 
 
 		 264 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  27.15 
 
 		 294 aa  48.9  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  31.84 
 
 		 559 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  24.83 
 
 		 289 aa  47.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  24.34 
 
 		 289 aa  47.8  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>