44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1161 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 310 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5680  copper resistance D domain-containing protein  42.31 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1126  copper resistance D domain-containing protein  45.89 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  33.05 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5432  copper resistance D domain-containing protein  40 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165296  normal  0.69712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  40.57 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  40.57 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  36.13 
 
 		 678 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.22 
 
 		 675 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 708 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  37.01 
 
 		 681 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  36.9 
 
 		 739 aa  58.9  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  32.77 
 
 		 613 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  28.01 
 
 		 343 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  35.77 
 
 		 687 aa  56.6  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  30.92 
 
 		 664 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  32.35 
 
 		 651 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  32.71 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.06 
 
 		 731 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  34.32 
 
 		 671 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  35.43 
 
 		 672 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  36.56 
 
 		 691 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3511  copper resistance D domain-containing protein  34.24 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  35.44 
 
 		 551 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  34.48 
 
 		 692 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  35.94 
 
 		 708 aa  50.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  38.78 
 
 		 722 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  33.92 
 
 		 687 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  31.36 
 
 		 519 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  37.17 
 
 		 649 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  32.68 
 
 		 686 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  36.46 
 
 		 559 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  37.74 
 
 		 671 aa  47.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  35 
 
 		 290 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 651 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27.72 
 
 		 364 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  33.15 
 
 		 676 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  31.58 
 
 		 718 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  29.63 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  35.43 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  32.54 
 
 		 571 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  28.12 
 
 		 642 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  30.11 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  33.08 
 
 		 576 aa  42.7  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>