65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2338 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  100 
 
 		 294 aa  580  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  99.66 
 
 		 294 aa  577  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  99.32 
 
 		 294 aa  574  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  59.52 
 
 		 293 aa  308  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  40.89 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  40.48 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  40.55 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  40.55 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  40.21 
 
 		 290 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  40.55 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  40.21 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  40.21 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  38.64 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  38.64 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  38.31 
 
 		 291 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  38.23 
 
 		 291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  39.52 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  39.52 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  38.57 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  38.78 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  32.65 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  34.81 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  30.07 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  31.34 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  28.44 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  33.85 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  28.85 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  31.02 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  29.05 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  33.56 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  29.97 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  28.62 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  28.78 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  29.93 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  28.78 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  32.7 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  32.54 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  27.52 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  28.75 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  27.92 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  33.85 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  29.91 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  31.99 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  24.09 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  31.14 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  34.53 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  29.52 
 
 		 708 aa  55.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  34.82 
 
 		 697 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  31.09 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  22.58 
 
 		 927 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27.96 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  30.23 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  32.93 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  33.92 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  27.37 
 
 		 687 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  31.28 
 
 		 528 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  33.33 
 
 		 512 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  27.57 
 
 		 551 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  28.18 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  31.03 
 
 		 547 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  33.1 
 
 		 651 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  31.16 
 
 		 672 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  26.52 
 
 		 718 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  32.95 
 
 		 549 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  32.95 
 
 		 544 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>