67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3413 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 309 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  43.61 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  38.56 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  39.8 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  41.18 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  38.36 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  39.29 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  38.96 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  38.96 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  37.91 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  37.34 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  39.34 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  36.39 
 
 		 309 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  37.36 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  33.44 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  34.91 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  32.14 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  34.42 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  35.25 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  33.21 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  30.16 
 
 		 290 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  29.34 
 
 		 309 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  32.69 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  27.53 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  26.47 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  25.41 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  26.47 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  26.47 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  26.47 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  25.41 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  25.41 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  26.47 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  25.41 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  25.73 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  26.56 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  26.56 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  26.14 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  23.7 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  26.23 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  23.7 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  23.44 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  30.05 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  34.11 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  29.38 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  37.01 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  29.87 
 
 		 551 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  27.33 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  25.93 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  27.91 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.51 
 
 		 613 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  22.55 
 
 		 927 aa  50.4  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  30.36 
 
 		 869 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  24.12 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  37.4 
 
 		 528 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2513  hypothetical protein  28.15 
 
 		 621 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  29.77 
 
 		 607 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2288  copper resistance D  26.98 
 
 		 166 aa  46.2  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.600323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  27.32 
 
 		 663 aa  45.8  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  33.33 
 
 		 544 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  33.33 
 
 		 544 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  31.43 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  32.29 
 
 		 439 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  32.29 
 
 		 547 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  27.07 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  32.29 
 
 		 544 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  29.46 
 
 		 400 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  31.25 
 
 		 544 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>